More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3092 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
791 aa  1658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  35.35 
 
 
729 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  34.47 
 
 
747 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  34.13 
 
 
745 aa  429  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  33.96 
 
 
726 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  30.96 
 
 
731 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 
698 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  30.16 
 
 
700 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
747 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  28.72 
 
 
744 aa  289  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  28.27 
 
 
791 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
777 aa  266  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 
776 aa  264  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  27.23 
 
 
756 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  26.36 
 
 
753 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  32.54 
 
 
891 aa  261  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 
755 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  27.27 
 
 
692 aa  256  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  27.36 
 
 
685 aa  247  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.15 
 
 
1139 aa  246  8e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 
1055 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.15 
 
 
1143 aa  243  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.15 
 
 
1135 aa  242  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  25.87 
 
 
749 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  31.63 
 
 
739 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  27.81 
 
 
728 aa  234  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  26.08 
 
 
694 aa  232  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 
711 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 
761 aa  221  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 
684 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  26.73 
 
 
758 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  26.43 
 
 
758 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  26.57 
 
 
758 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  26.29 
 
 
758 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.93 
 
 
759 aa  218  4e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  26.29 
 
 
758 aa  218  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
726 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  25.22 
 
 
761 aa  212  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.48 
 
 
760 aa  212  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
726 aa  210  7e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
726 aa  210  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
734 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 
688 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  25.26 
 
 
757 aa  209  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  28.88 
 
 
739 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 
737 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
718 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 
731 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
718 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
718 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
764 aa  206  9e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  25.46 
 
 
708 aa  206  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
738 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 
764 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 
760 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
695 aa  205  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  26 
 
 
750 aa  205  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  27.5 
 
 
697 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 
760 aa  204  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  24.87 
 
 
756 aa  204  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  25.07 
 
 
737 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  25.37 
 
 
673 aa  202  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.97 
 
 
764 aa  202  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  25.47 
 
 
754 aa  201  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  26.32 
 
 
710 aa  201  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.87 
 
 
764 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  32.76 
 
 
722 aa  200  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.58 
 
 
760 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.76 
 
 
793 aa  198  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  29.19 
 
 
709 aa  198  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
760 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.97 
 
 
685 aa  197  7e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.7 
 
 
758 aa  197  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 
703 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.13 
 
 
760 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 
794 aa  196  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  28.42 
 
 
899 aa  195  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2549  molydopterin dinucleotide-binding region  24.93 
 
 
737 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 
674 aa  194  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 
764 aa  193  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
729 aa  192  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 
708 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 
744 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.05 
 
 
893 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.83 
 
 
688 aa  191  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 
673 aa  191  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
691 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.6 
 
 
730 aa  189  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  27.59 
 
 
687 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 
670 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 
691 aa  187  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  25.2 
 
 
674 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.64 
 
 
900 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.97 
 
 
808 aa  185  4.0000000000000006e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.06 
 
 
679 aa  183  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  24.7 
 
 
737 aa  182  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  27.81 
 
 
807 aa  182  2e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 
988 aa  181  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  24.3 
 
 
695 aa  181  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>