More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1999 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  79.31 
 
 		 760 aa  1285    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  74.84 
 
 		 758 aa  1215    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  79.05 
 
 		 760 aa  1296    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  78.79 
 
 		 764 aa  1291    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  80.9 
 
 		 764 aa  1310    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  81.03 
 
 		 764 aa  1310    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  77.63 
 
 		 760 aa  1290    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 760 aa  1589    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  45.64 
 
 		 764 aa  668    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  80.63 
 
 		 764 aa  1305    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  75.49 
 
 		 760 aa  1205    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  56.33 
 
 		 758 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  56.6 
 
 		 758 aa  898    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  56.6 
 
 		 758 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  80 
 
 		 760 aa  1293    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  57.89 
 
 		 756 aa  924    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  56.33 
 
 		 758 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  56.6 
 
 		 758 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  79.05 
 
 		 764 aa  1295    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  41.22 
 
 		 761 aa  632  1e-180  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  40.42 
 
 		 757 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  39.06 
 
 		 754 aa  594  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  33.07 
 
 		 759 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 695 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.29 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  32.43 
 
 		 730 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  32.18 
 
 		 731 aa  364  4e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  31.82 
 
 		 698 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  32.34 
 
 		 700 aa  350  6e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  31.89 
 
 		 807 aa  347  4e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 		 695 aa  347  6e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  31.85 
 
 		 695 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  30.6 
 
 		 750 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  31.73 
 
 		 731 aa  325  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  31.28 
 
 		 738 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  30.81 
 
 		 708 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  31.28 
 
 		 737 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  31.58 
 
 		 704 aa  313  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  32.33 
 
 		 739 aa  310  5e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 729 aa  310  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  31.41 
 
 		 739 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 		 747 aa  301  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  30.14 
 
 		 744 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  28.95 
 
 		 731 aa  296  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.28 
 
 		 731 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 739 aa  283  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 		 731 aa  282  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  30.27 
 
 		 720 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  28.64 
 
 		 741 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  29.27 
 
 		 747 aa  273  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 738 aa  272  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  29.95 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.96 
 
 		 734 aa  269  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 		 745 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 879 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.12 
 
 		 732 aa  250  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.01 
 
 		 692 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.78 
 
 		 685 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 729 aa  232  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 		 879 aa  231  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.34 
 
 		 739 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 		 812 aa  228  4e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.55 
 
 		 833 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 1139 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.25 
 
 		 1143 aa  219  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  28.37 
 
 		 936 aa  218  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.05 
 
 		 749 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 		 837 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 		 891 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  27.75 
 
 		 711 aa  209  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 		 711 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 		 731 aa  205  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.29 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  25.41 
 
 		 791 aa  204  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 		 726 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.64 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.61 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  25.91 
 
 		 1135 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.61 
 
 		 792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  24.97 
 
 		 733 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.52 
 
 		 792 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.43 
 
 		 804 aa  200  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.44 
 
 		 708 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.1 
 
 		 781 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  24.83 
 
 		 733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.23 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 709 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 		 1087 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.8 
 
 		 793 aa  197  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.59 
 
 		 711 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.69 
 
 		 688 aa  196  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  24.93 
 
 		 744 aa  193  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.53 
 
 		 893 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  26.08 
 
 		 737 aa  193  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 		 843 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.14 
 
 		 814 aa  190  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  26.14 
 
 		 814 aa  190  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.14 
 
 		 814 aa  190  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>