More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1318 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  64.12 
 
 		 695 aa  922    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  62.95 
 
 		 708 aa  891    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  54.52 
 
 		 704 aa  772    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 695 aa  1429    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  63.58 
 
 		 698 aa  929    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  64.83 
 
 		 700 aa  921    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  47.05 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  35.7 
 
 		 731 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  32.86 
 
 		 760 aa  363  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  33 
 
 		 760 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  32.86 
 
 		 764 aa  355  2e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  32.71 
 
 		 764 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  32.71 
 
 		 764 aa  353  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  34.99 
 
 		 731 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 		 764 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 		 760 aa  347  6e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  32.62 
 
 		 730 aa  346  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  32.9 
 
 		 764 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  33.29 
 
 		 761 aa  343  7e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  33.43 
 
 		 722 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  30.64 
 
 		 754 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  31.47 
 
 		 760 aa  336  7e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 760 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  32.18 
 
 		 760 aa  336  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  32.73 
 
 		 757 aa  334  4e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 		 758 aa  333  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 		 759 aa  327  7e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 		 764 aa  327  7e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  30.47 
 
 		 758 aa  325  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  30.47 
 
 		 758 aa  324  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  30.33 
 
 		 758 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  30.33 
 
 		 758 aa  323  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  30.33 
 
 		 758 aa  323  7e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 		 729 aa  321  3e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  32.96 
 
 		 750 aa  314  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 738 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  32.73 
 
 		 739 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 		 756 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 737 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  33.01 
 
 		 744 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 		 731 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  30.66 
 
 		 741 aa  282  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  31.38 
 
 		 731 aa  281  3e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  30.04 
 
 		 720 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 		 739 aa  267  5e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 		 731 aa  266  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  31.23 
 
 		 747 aa  265  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  29.79 
 
 		 739 aa  262  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  29.51 
 
 		 738 aa  254  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  31.86 
 
 		 807 aa  251  4e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.84 
 
 		 733 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 698 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.45 
 
 		 734 aa  234  3e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.35 
 
 		 732 aa  234  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 		 891 aa  218  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 		 729 aa  213  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 		 747 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 		 726 aa  198  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 		 745 aa  196  9e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  28 
 
 		 711 aa  194  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 812 aa  189  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.95 
 
 		 1143 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  26.79 
 
 		 1135 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 936 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  25.89 
 
 		 739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 		 709 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 700 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25 
 
 		 685 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  24.3 
 
 		 791 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.2 
 
 		 1139 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 		 731 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 711 aa  177  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  23.34 
 
 		 692 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  25.66 
 
 		 749 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 		 708 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.6 
 
 		 879 aa  169  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 		 734 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 837 aa  167  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  25.78 
 
 		 899 aa  166  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 		 717 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 694 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.84 
 
 		 708 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  23.6 
 
 		 669 aa  165  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  26.07 
 
 		 711 aa  165  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.38 
 
 		 688 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  23.53 
 
 		 1055 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 879 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.35 
 
 		 685 aa  163  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.35 
 
 		 900 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  28.95 
 
 		 826 aa  162  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 		 761 aa  161  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  26.28 
 
 		 713 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.04 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  23.78 
 
 		 732 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  25.63 
 
 		 799 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  26.68 
 
 		 715 aa  157  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  25.79 
 
 		 745 aa  157  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  23.72 
 
 		 744 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.67 
 
 		 893 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 		 725 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>