More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2235 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  56.33 
 
 
764 aa  914    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  56.73 
 
 
760 aa  919    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  100 
 
 
758 aa  1580    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  56.07 
 
 
760 aa  906    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  53.33 
 
 
756 aa  825    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  56.46 
 
 
764 aa  922    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  56.46 
 
 
764 aa  921    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  56.6 
 
 
760 aa  922    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  99.34 
 
 
758 aa  1573    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  99.34 
 
 
758 aa  1570    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  56.07 
 
 
764 aa  914    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  55.2 
 
 
760 aa  884    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  56.73 
 
 
758 aa  920    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  99.21 
 
 
758 aa  1572    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  57.12 
 
 
760 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  56.2 
 
 
760 aa  914    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  99.34 
 
 
758 aa  1574    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  56.2 
 
 
764 aa  912    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  40.05 
 
 
761 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  41.12 
 
 
764 aa  591  1e-167  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  38.48 
 
 
757 aa  571  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  38.74 
 
 
754 aa  571  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  34.79 
 
 
695 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  35.36 
 
 
722 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  32.5 
 
 
730 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  33.15 
 
 
731 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  32.5 
 
 
759 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 
698 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  33 
 
 
695 aa  367  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  33.66 
 
 
738 aa  354  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  32 
 
 
700 aa  353  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  33.43 
 
 
739 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  33.66 
 
 
737 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 
695 aa  336  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  29.95 
 
 
750 aa  333  6e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  30.9 
 
 
731 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  31.97 
 
 
708 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  31.15 
 
 
731 aa  325  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  30.34 
 
 
704 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
729 aa  306  6e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 
807 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.22 
 
 
744 aa  301  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 
731 aa  294  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 
731 aa  278  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  29.14 
 
 
747 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  30.15 
 
 
720 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 
733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  29.68 
 
 
738 aa  269  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 
741 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
747 aa  267  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  29.15 
 
 
739 aa  266  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  30.37 
 
 
739 aa  261  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
745 aa  258  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.37 
 
 
734 aa  253  8.000000000000001e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  28.18 
 
 
732 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 
729 aa  243  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 
891 aa  240  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.89 
 
 
685 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.07 
 
 
1143 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 
812 aa  232  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  28.03 
 
 
1139 aa  231  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
791 aa  224  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  28.49 
 
 
1135 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 
711 aa  217  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 
698 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.13 
 
 
749 aa  213  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
843 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.16 
 
 
692 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.28 
 
 
833 aa  209  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 
879 aa  207  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.52 
 
 
739 aa  207  8e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  26.99 
 
 
711 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
837 aa  204  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.67 
 
 
731 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 
726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 
734 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 
709 aa  202  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 
879 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  26.22 
 
 
799 aa  200  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.71 
 
 
808 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.71 
 
 
808 aa  200  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.83 
 
 
808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  26.71 
 
 
808 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  26.71 
 
 
808 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 
777 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  25.37 
 
 
855 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.99 
 
 
808 aa  195  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.59 
 
 
808 aa  194  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.71 
 
 
808 aa  194  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  25.62 
 
 
816 aa  194  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.99 
 
 
685 aa  193  8e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.44 
 
 
816 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.62 
 
 
816 aa  193  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1570  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  26.98 
 
 
774 aa  193  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  25.78 
 
 
756 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
711 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 
747 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.35 
 
 
808 aa  191  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  25.1 
 
 
744 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>