More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0555 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  98.03 
 
 
760 aa  1550    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  56.33 
 
 
758 aa  894    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  93.03 
 
 
760 aa  1488    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  56.2 
 
 
758 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
764 aa  1591    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  79.45 
 
 
760 aa  1292    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  56.33 
 
 
758 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  93.06 
 
 
764 aa  1506    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  92.93 
 
 
764 aa  1505    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  78.79 
 
 
760 aa  1291    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  42.39 
 
 
761 aa  640    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  93.46 
 
 
764 aa  1508    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  78 
 
 
760 aa  1238    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  58.23 
 
 
756 aa  921    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  46.36 
 
 
764 aa  684    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  98.56 
 
 
764 aa  1566    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  56.07 
 
 
758 aa  892    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  82.08 
 
 
760 aa  1322    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  78.36 
 
 
758 aa  1269    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  56.33 
 
 
758 aa  895    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  41.68 
 
 
757 aa  615  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  42.04 
 
 
754 aa  608  1e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  34.24 
 
 
695 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  33.72 
 
 
730 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 
759 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.13 
 
 
722 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  32.54 
 
 
731 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  34.6 
 
 
695 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  32.1 
 
 
698 aa  362  1e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  33.05 
 
 
700 aa  362  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  32.22 
 
 
731 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 
695 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  32.95 
 
 
708 aa  342  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 
738 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  31.05 
 
 
750 aa  340  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  31.44 
 
 
807 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 
737 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 
739 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  30.98 
 
 
729 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  30.49 
 
 
731 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  30.31 
 
 
744 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  32.29 
 
 
739 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  30.98 
 
 
704 aa  302  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  31.9 
 
 
747 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 
731 aa  293  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  31.46 
 
 
738 aa  291  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 
731 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  30.04 
 
 
741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 
739 aa  287  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  31.11 
 
 
720 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.87 
 
 
734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
733 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 
745 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 
747 aa  257  6e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  27.67 
 
 
685 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.75 
 
 
837 aa  238  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  26.63 
 
 
732 aa  231  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.27 
 
 
879 aa  229  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.33 
 
 
833 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
698 aa  225  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.05 
 
 
739 aa  225  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 
729 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.41 
 
 
700 aa  224  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
711 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
936 aa  221  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.41 
 
 
685 aa  217  5e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.36 
 
 
749 aa  217  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.42 
 
 
792 aa  217  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.76 
 
 
792 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.76 
 
 
792 aa  216  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  26.62 
 
 
733 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.76 
 
 
792 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.76 
 
 
792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  29.47 
 
 
879 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3659  twin-arginine translocation pathway signal  26.49 
 
 
733 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.36 
 
 
692 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
812 aa  214  7e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.86 
 
 
799 aa  211  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  25.89 
 
 
731 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  27.4 
 
 
737 aa  207  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
791 aa  206  9e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4211  molydopterin dinucleotide-binding region  26.53 
 
 
738 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 
843 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  26.38 
 
 
1143 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.27 
 
 
781 aa  205  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  27.14 
 
 
694 aa  205  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 
891 aa  204  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  26.63 
 
 
1139 aa  204  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.65 
 
 
893 aa  203  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.1 
 
 
1135 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
856 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.49 
 
 
793 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 
709 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  25.97 
 
 
899 aa  201  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  31.59 
 
 
711 aa  201  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.75 
 
 
900 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  29.98 
 
 
1087 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.84 
 
 
893 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.54 
 
 
689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.18 
 
 
726 aa  198  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>