More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2436 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
936 aa  1945    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 
695 aa  258  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  31.99 
 
 
731 aa  250  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  31.89 
 
 
722 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  30.33 
 
 
760 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  29.26 
 
 
760 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
764 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.31 
 
 
760 aa  234  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  28.74 
 
 
764 aa  231  5e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 
764 aa  231  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 
807 aa  227  9e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  29.58 
 
 
750 aa  226  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 
760 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
760 aa  224  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
764 aa  222  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
764 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 
759 aa  221  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.85 
 
 
1143 aa  221  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.1 
 
 
731 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  29.26 
 
 
685 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 
758 aa  218  5e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  28.37 
 
 
760 aa  218  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.86 
 
 
1139 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.82 
 
 
799 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.48 
 
 
688 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.72 
 
 
1135 aa  212  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  28.3 
 
 
741 aa  210  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 
764 aa  209  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.67 
 
 
808 aa  208  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  27.33 
 
 
808 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  27.33 
 
 
808 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.33 
 
 
808 aa  207  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.2 
 
 
808 aa  205  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.33 
 
 
808 aa  204  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.33 
 
 
808 aa  204  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.2 
 
 
808 aa  204  6e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.59 
 
 
685 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  27.2 
 
 
808 aa  203  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 
744 aa  201  6e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 
733 aa  201  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1601  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.06 
 
 
812 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.18 
 
 
730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1840  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.93 
 
 
812 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1669  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.93 
 
 
812 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856631  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.93 
 
 
812 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462198  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.83 
 
 
794 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1673  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.93 
 
 
812 aa  198  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  28 
 
 
739 aa  197  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  28.78 
 
 
729 aa  197  9e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.75 
 
 
689 aa  197  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
747 aa  195  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  26.52 
 
 
720 aa  194  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 
729 aa  194  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 
747 aa  194  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
738 aa  194  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 
711 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.16 
 
 
814 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.34 
 
 
814 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.34 
 
 
814 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.34 
 
 
814 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  26.71 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.71 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.74 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.71 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.23 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 
1055 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  26.71 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.71 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.34 
 
 
814 aa  193  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.8 
 
 
814 aa  192  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.2 
 
 
814 aa  193  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.41 
 
 
817 aa  191  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  26.23 
 
 
757 aa  189  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.46 
 
 
816 aa  190  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 
739 aa  190  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26.32 
 
 
879 aa  189  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.84 
 
 
692 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.66 
 
 
893 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  25.54 
 
 
761 aa  189  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  25.4 
 
 
738 aa  189  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.82 
 
 
900 aa  188  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.86 
 
 
756 aa  187  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.71 
 
 
734 aa  187  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.74 
 
 
799 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 
695 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.49 
 
 
816 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.66 
 
 
691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
695 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 
745 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 
737 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.48 
 
 
807 aa  186  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  27.62 
 
 
816 aa  185  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.48 
 
 
798 aa  185  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 
698 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.62 
 
 
781 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 
731 aa  184  6e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27.35 
 
 
816 aa  184  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  26.3 
 
 
739 aa  184  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.35 
 
 
798 aa  183  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  26.35 
 
 
807 aa  184  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>