More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1580 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
694 aa  1441    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  34.82 
 
 
749 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  35.4 
 
 
761 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 
698 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  33.84 
 
 
1135 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  33.24 
 
 
1139 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 
729 aa  317  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 
711 aa  316  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  31.28 
 
 
739 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  33.38 
 
 
1143 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 
747 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.84 
 
 
745 aa  300  6e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  29.35 
 
 
692 aa  291  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  30.53 
 
 
685 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
747 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 
700 aa  263  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 
891 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 
726 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  28.69 
 
 
753 aa  242  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
794 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
776 aa  241  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  27.92 
 
 
744 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
1055 aa  239  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 
777 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  26.08 
 
 
791 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.03 
 
 
879 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  27.64 
 
 
756 aa  224  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  26.98 
 
 
791 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 
697 aa  217  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 
703 aa  216  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.99 
 
 
731 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 
695 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.53 
 
 
766 aa  212  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 
764 aa  212  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  26.52 
 
 
695 aa  210  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 
764 aa  210  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
691 aa  210  8e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  27.71 
 
 
764 aa  210  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.41 
 
 
703 aa  210  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.45 
 
 
1130 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 
727 aa  209  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.01 
 
 
1111 aa  208  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
759 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
760 aa  208  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  28.53 
 
 
687 aa  206  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.47 
 
 
685 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 
688 aa  206  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  27.79 
 
 
760 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
764 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.14 
 
 
764 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
760 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  28.32 
 
 
688 aa  205  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.23 
 
 
899 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
755 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.95 
 
 
691 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 
691 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 
691 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.01 
 
 
692 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.11 
 
 
731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 
690 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  29.24 
 
 
692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 
688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.44 
 
 
688 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 
760 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 
688 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.25 
 
 
904 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  31.88 
 
 
807 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 
692 aa  201  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.6 
 
 
760 aa  200  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
691 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.75 
 
 
924 aa  200  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 
694 aa  200  7.999999999999999e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  31.33 
 
 
684 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  26.45 
 
 
689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  27.96 
 
 
695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.63 
 
 
698 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
691 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
698 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.83 
 
 
754 aa  198  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
739 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.1 
 
 
688 aa  197  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 
803 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 
988 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 
988 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 
698 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 
758 aa  194  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.31 
 
 
688 aa  194  5e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 
692 aa  194  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.16 
 
 
917 aa  193  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
691 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
691 aa  193  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.55 
 
 
945 aa  193  9e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 
781 aa  193  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  32.13 
 
 
820 aa  193  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.1 
 
 
1110 aa  193  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.64 
 
 
925 aa  192  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 
691 aa  192  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  26.68 
 
 
741 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
1180 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
715 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>