More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5226 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.18 
 
 		 961 aa  1126    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.54 
 
 		 925 aa  1195    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.89 
 
 		 955 aa  1025    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.18 
 
 		 937 aa  1183    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.79 
 
 		 957 aa  1121    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.08 
 
 		 886 aa  703    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.86 
 
 		 893 aa  681    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.73 
 
 		 879 aa  726    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.21 
 
 		 893 aa  640    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.7 
 
 		 917 aa  723    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  84.52 
 
 		 989 aa  1705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.38 
 
 		 963 aa  1125    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  92.41 
 
 		 988 aa  1884    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  42.31 
 
 		 899 aa  693    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.23 
 
 		 924 aa  1180    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 900 aa  671    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.31 
 
 		 933 aa  1232    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.22 
 
 		 949 aa  1173    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.51 
 
 		 942 aa  1084    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  85.8 
 
 		 989 aa  1726    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 988 aa  2031    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.13 
 
 		 963 aa  1126    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.28 
 
 		 945 aa  1194    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.42 
 
 		 953 aa  1197    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.1 
 
 		 924 aa  1164    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.93 
 
 		 898 aa  679    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.4 
 
 		 929 aa  1244    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  85.16 
 
 		 989 aa  1709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.69 
 
 		 893 aa  674    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.04 
 
 		 927 aa  1142    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  49.89 
 
 		 909 aa  872    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  85.16 
 
 		 989 aa  1710    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.3 
 
 		 900 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 905 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  99.9 
 
 		 988 aa  2028    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 		 904 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.7 
 
 		 901 aa  631  1e-179  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  37 
 
 		 906 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 		 920 aa  622  1e-177  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.51 
 
 		 911 aa  614  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 		 952 aa  615  9.999999999999999e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  41.12 
 
 		 1412 aa  612  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.07 
 
 		 1385 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  40.62 
 
 		 1387 aa  609  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 947 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.31 
 
 		 1440 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.48 
 
 		 983 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.73 
 
 		 1406 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.85 
 
 		 946 aa  596  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 		 982 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.83 
 
 		 952 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.49 
 
 		 960 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 		 959 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.98 
 
 		 983 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.35 
 
 		 960 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  36.1 
 
 		 982 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 		 983 aa  595  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.93 
 
 		 1421 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 979 aa  594  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.66 
 
 		 951 aa  592  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.37 
 
 		 983 aa  592  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.22 
 
 		 967 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.08 
 
 		 944 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 		 949 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.15 
 
 		 959 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.71 
 
 		 966 aa  587  1e-166  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 		 946 aa  588  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.28 
 
 		 960 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.3 
 
 		 1425 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.9 
 
 		 1428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 		 1425 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.76 
 
 		 983 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.98 
 
 		 1426 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 		 948 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 950 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.87 
 
 		 983 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.2 
 
 		 977 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.58 
 
 		 1424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.87 
 
 		 983 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 		 959 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 		 1425 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.87 
 
 		 956 aa  582  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 950 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.24 
 
 		 948 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 950 aa  582  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.6 
 
 		 969 aa  578  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.59 
 
 		 959 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 1410 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.88 
 
 		 956 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.09 
 
 		 984 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  35.71 
 
 		 957 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.78 
 
 		 947 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 		 953 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.02 
 
 		 948 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.44 
 
 		 1440 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.16 
 
 		 948 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.23 
 
 		 1000 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.79 
 
 		 984 aa  571  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.48 
 
 		 973 aa  570  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 984 aa  570  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>