More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3470 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.06 
 
 		 989 aa  1130    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.29 
 
 		 924 aa  1049    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.64 
 
 		 925 aa  1249    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.13 
 
 		 988 aa  1147    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.67 
 
 		 933 aa  1029    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 893 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 		 893 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  98.23 
 
 		 961 aa  1903    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.34 
 
 		 937 aa  1263    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.96 
 
 		 989 aa  1128    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  77.84 
 
 		 957 aa  1542    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.06 
 
 		 886 aa  689    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.49 
 
 		 955 aa  1061    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 963 aa  1969    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.37 
 
 		 963 aa  1467    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.68 
 
 		 949 aa  1049    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  41.13 
 
 		 899 aa  697    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.13 
 
 		 988 aa  1147    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.08 
 
 		 989 aa  1129    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.38 
 
 		 900 aa  637    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  74.65 
 
 		 942 aa  1440    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.04 
 
 		 945 aa  1238    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.65 
 
 		 953 aa  1065    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.99 
 
 		 924 aa  986    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.38 
 
 		 929 aa  1079    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.19 
 
 		 927 aa  1167    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.48 
 
 		 989 aa  1143    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.05 
 
 		 898 aa  655    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.75 
 
 		 988 aa  1150    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.37 
 
 		 920 aa  640    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.88 
 
 		 917 aa  662    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  48.14 
 
 		 909 aa  836    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.18 
 
 		 904 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.86 
 
 		 879 aa  677    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.63 
 
 		 900 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 		 905 aa  634  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.34 
 
 		 901 aa  620  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.07 
 
 		 906 aa  615  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 893 aa  607  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 		 949 aa  594  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.48 
 
 		 947 aa  589  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.65 
 
 		 911 aa  592  1e-167  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.34 
 
 		 977 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.63 
 
 		 1385 aa  584  1.0000000000000001e-165  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.13 
 
 		 952 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.44 
 
 		 944 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.39 
 
 		 951 aa  578  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.34 
 
 		 967 aa  575  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.27 
 
 		 966 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 		 983 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  41.29 
 
 		 1387 aa  571  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.66 
 
 		 983 aa  572  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.03 
 
 		 677 aa  572  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.35 
 
 		 983 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 		 946 aa  568  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 		 983 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.77 
 
 		 948 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 		 948 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 		 959 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.69 
 
 		 956 aa  562  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.36 
 
 		 969 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 960 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  40.22 
 
 		 1412 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 1421 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.61 
 
 		 984 aa  562  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.65 
 
 		 979 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.51 
 
 		 984 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.89 
 
 		 982 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.69 
 
 		 983 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.45 
 
 		 946 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.68 
 
 		 982 aa  560  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.69 
 
 		 983 aa  562  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.13 
 
 		 1440 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 		 983 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.31 
 
 		 984 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.31 
 
 		 959 aa  556  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 984 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.16 
 
 		 960 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 984 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.64 
 
 		 956 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.1 
 
 		 948 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.1 
 
 		 952 aa  558  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.41 
 
 		 984 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 960 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 984 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.99 
 
 		 959 aa  559  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 984 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.39 
 
 		 1406 aa  559  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.52 
 
 		 947 aa  557  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.13 
 
 		 951 aa  558  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 		 903 aa  558  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 		 959 aa  558  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.07 
 
 		 957 aa  555  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 		 959 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.65 
 
 		 676 aa  552  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 		 1440 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 		 948 aa  552  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  34.5 
 
 		 957 aa  552  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.63 
 
 		 959 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.24 
 
 		 959 aa  552  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>