More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3509 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.23 
 
 		 893 aa  844    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 		 959 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.29 
 
 		 983 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 		 946 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.09 
 
 		 957 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.22 
 
 		 960 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 969 aa  660    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 		 947 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.47 
 
 		 925 aa  706    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.89 
 
 		 950 aa  668    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.91 
 
 		 1000 aa  681    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.5 
 
 		 967 aa  678    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.65 
 
 		 966 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.72 
 
 		 1428 aa  676    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 		 946 aa  668    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.67 
 
 		 917 aa  848    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.19 
 
 		 950 aa  671    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.84 
 
 		 983 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.14 
 
 		 676 aa  640    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.11 
 
 		 960 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.41 
 
 		 1440 aa  693    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 984 aa  683    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.6 
 
 		 960 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 988 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 1410 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 		 956 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.91 
 
 		 937 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.89 
 
 		 951 aa  646    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.1 
 
 		 688 aa  635    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.66 
 
 		 984 aa  685    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 		 955 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.66 
 
 		 984 aa  685    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.53 
 
 		 989 aa  651    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 		 952 aa  676    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.4 
 
 		 983 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 957 aa  654    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 		 963 aa  674    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.96 
 
 		 979 aa  663    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.89 
 
 		 956 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.53 
 
 		 989 aa  651    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.05 
 
 		 1440 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 984 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  39.2 
 
 		 977 aa  665    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 		 978 aa  646    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 		 988 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.39 
 
 		 989 aa  656    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  48.73 
 
 		 899 aa  895    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.05 
 
 		 893 aa  876    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.88 
 
 		 984 aa  683    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 1425 aa  653    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.88 
 
 		 948 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.8 
 
 		 952 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.72 
 
 		 953 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.45 
 
 		 959 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.11 
 
 		 982 aa  673    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.16 
 
 		 983 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.37 
 
 		 1426 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  65.53 
 
 		 527 aa  726    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 984 aa  683    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.38 
 
 		 942 aa  635    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.32 
 
 		 950 aa  674    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.95 
 
 		 933 aa  681    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.87 
 
 		 948 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 949 aa  660    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.76 
 
 		 945 aa  680    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  40.02 
 
 		 982 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.51 
 
 		 948 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  43.39 
 
 		 1385 aa  677    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  40.36 
 
 		 957 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.95 
 
 		 1421 aa  669    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.41 
 
 		 924 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.27 
 
 		 983 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.29 
 
 		 900 aa  800    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 988 aa  646    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.66 
 
 		 984 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.97 
 
 		 904 aa  824    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.63 
 
 		 1432 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.75 
 
 		 1432 aa  660    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 		 927 aa  677    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.15 
 
 		 1406 aa  661    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.02 
 
 		 1424 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.22 
 
 		 960 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.54 
 
 		 959 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2684  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.4 
 
 		 951 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.801873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.18 
 
 		 983 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.99 
 
 		 959 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.32 
 
 		 1425 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.02 
 
 		 948 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.27 
 
 		 983 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 984 aa  683    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.34 
 
 		 1425 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.22 
 
 		 920 aa  762    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.93 
 
 		 944 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0030  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  88.55 
 
 		 359 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00062453  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0031  molybdopterin oxidoreductase  75.33 
 
 		 528 aa  867    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.760475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 959 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.34 
 
 		 959 aa  658    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.34 
 
 		 989 aa  661    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 905 aa  1890    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.45 
 
 		 1432 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>