More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2377 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  45.32 
 
 
747 aa  681    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  47.84 
 
 
756 aa  723    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  48.82 
 
 
744 aa  735    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  100 
 
 
791 aa  1657    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  43.87 
 
 
755 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  41.56 
 
 
753 aa  560  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  41.36 
 
 
776 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  39.57 
 
 
794 aa  548  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  39.77 
 
 
777 aa  537  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  33.74 
 
 
747 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 
729 aa  343  9e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  31.7 
 
 
739 aa  335  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  32.26 
 
 
745 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  29.48 
 
 
698 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 
726 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 
791 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 
1055 aa  277  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 
700 aa  277  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  29.3 
 
 
1139 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  29.65 
 
 
1135 aa  273  1e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 
891 aa  272  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  29.11 
 
 
749 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 
711 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.42 
 
 
1143 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 
731 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
761 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  28.4 
 
 
726 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 
726 aa  223  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.67 
 
 
691 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 
691 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 
691 aa  220  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
694 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  28.53 
 
 
709 aa  217  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.74 
 
 
692 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  32.9 
 
 
952 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  27.52 
 
 
898 aa  209  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
698 aa  209  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.32 
 
 
691 aa  208  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
718 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
718 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
666 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  27.21 
 
 
698 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
691 aa  206  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 
718 aa  204  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.75 
 
 
691 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  27.32 
 
 
692 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.99 
 
 
691 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.99 
 
 
691 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.83 
 
 
708 aa  200  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25.56 
 
 
685 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 
688 aa  197  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.99 
 
 
691 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 
703 aa  197  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 
728 aa  196  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  26.65 
 
 
698 aa  195  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 
712 aa  194  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 
692 aa  194  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 
691 aa  193  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
701 aa  193  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.31 
 
 
708 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 
720 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.65 
 
 
942 aa  192  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  25.48 
 
 
710 aa  190  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 
670 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.73 
 
 
803 aa  187  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
690 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  30.98 
 
 
964 aa  186  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 
703 aa  185  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27 
 
 
792 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.1 
 
 
792 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.1 
 
 
792 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  26.03 
 
 
689 aa  180  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
684 aa  180  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 
692 aa  179  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.8 
 
 
792 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.8 
 
 
792 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 
673 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.19 
 
 
814 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.27 
 
 
759 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.19 
 
 
814 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.19 
 
 
814 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.19 
 
 
814 aa  175  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.84 
 
 
685 aa  174  5e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.28 
 
 
814 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.14 
 
 
759 aa  174  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25 
 
 
759 aa  174  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 
727 aa  173  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  28.44 
 
 
1002 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.42 
 
 
1018 aa  173  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27.45 
 
 
814 aa  173  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  24.66 
 
 
759 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
732 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  26.67 
 
 
899 aa  172  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.76 
 
 
731 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  23.49 
 
 
1138 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  27.32 
 
 
814 aa  172  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.32 
 
 
814 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 
697 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>