More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16890 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  44.38 
 
 
964 aa  785    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  43.52 
 
 
1017 aa  805    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  45.9 
 
 
952 aa  840    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  40.6 
 
 
1053 aa  682    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  41.25 
 
 
1032 aa  714    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  73.58 
 
 
1002 aa  1550    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 
1018 aa  2127    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  45.18 
 
 
1023 aa  831    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.8 
 
 
1003 aa  605  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  44.3 
 
 
1102 aa  425  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  41.85 
 
 
1193 aa  383  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 
971 aa  274  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 
803 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 
803 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
807 aa  248  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.52 
 
 
942 aa  238  5.0000000000000005e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
1148 aa  206  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  24.62 
 
 
1138 aa  181  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  27.42 
 
 
791 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  34.26 
 
 
898 aa  165  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  32.08 
 
 
945 aa  161  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.1 
 
 
953 aa  159  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  34.16 
 
 
910 aa  154  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 
747 aa  151  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
745 aa  151  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  27.14 
 
 
744 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  35.08 
 
 
776 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
729 aa  144  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  27.05 
 
 
755 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  27.83 
 
 
753 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  34.69 
 
 
777 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  24.39 
 
 
818 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.12 
 
 
979 aa  141  4.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  35.88 
 
 
781 aa  140  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
747 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 
765 aa  140  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  22.91 
 
 
979 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  34.88 
 
 
794 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  26.13 
 
 
756 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  34.01 
 
 
749 aa  135  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.74 
 
 
981 aa  135  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  30.87 
 
 
843 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  32.85 
 
 
1155 aa  132  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  22.69 
 
 
974 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  30.07 
 
 
759 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  24.16 
 
 
698 aa  128  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  31.86 
 
 
761 aa  127  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  30.95 
 
 
820 aa  125  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
734 aa  125  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  29.55 
 
 
732 aa  125  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  30.43 
 
 
722 aa  124  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  21.42 
 
 
928 aa  121  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  31.39 
 
 
821 aa  121  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  24.81 
 
 
917 aa  121  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  30.62 
 
 
731 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  30.79 
 
 
732 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  28.25 
 
 
817 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 
839 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 
764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 
744 aa  120  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 
764 aa  119  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  29.21 
 
 
764 aa  119  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  28.01 
 
 
789 aa  119  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  32.68 
 
 
911 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 
726 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  32.96 
 
 
1142 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.43 
 
 
824 aa  118  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.52 
 
 
760 aa  118  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.77 
 
 
792 aa  118  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.77 
 
 
792 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  22.6 
 
 
932 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  26.38 
 
 
836 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.77 
 
 
792 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.77 
 
 
792 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  29.43 
 
 
792 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.85 
 
 
730 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 
673 aa  116  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  27.94 
 
 
909 aa  116  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.8 
 
 
739 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2923  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  30 
 
 
810 aa  115  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  21.86 
 
 
973 aa  115  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  21.86 
 
 
978 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  21.96 
 
 
930 aa  114  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  21.86 
 
 
973 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
760 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 
1055 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
764 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 
764 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 
784 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 
891 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  28.08 
 
 
758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  28.08 
 
 
758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  28.08 
 
 
758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  26.94 
 
 
747 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  28.08 
 
 
758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  27.87 
 
 
947 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
858 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  28.52 
 
 
953 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.29 
 
 
816 aa  112  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  32.95 
 
 
856 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>