More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05600 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 
979 aa  2048    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  76.19 
 
 
945 aa  1546    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.97 
 
 
942 aa  592  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  36.22 
 
 
910 aa  578  1.0000000000000001e-163  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  34.7 
 
 
898 aa  551  1e-155  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  25.66 
 
 
952 aa  198  4.0000000000000005e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.37 
 
 
1003 aa  181  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  24.32 
 
 
1002 aa  172  4e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.37 
 
 
839 aa  158  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
971 aa  158  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.78 
 
 
807 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  32.26 
 
 
745 aa  146  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  31.31 
 
 
1102 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  35.18 
 
 
777 aa  144  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  31.13 
 
 
729 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.67 
 
 
864 aa  140  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 
747 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 
817 aa  138  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 
794 aa  137  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 
776 aa  137  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  30.4 
 
 
753 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.27 
 
 
813 aa  137  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.41 
 
 
857 aa  137  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  28.64 
 
 
821 aa  136  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.2 
 
 
1061 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  33.07 
 
 
744 aa  135  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.23 
 
 
824 aa  135  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 
734 aa  135  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  34.12 
 
 
730 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  34.13 
 
 
731 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02110  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.26 
 
 
806 aa  132  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292195  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.22 
 
 
1018 aa  131  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 
789 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 
876 aa  130  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  31.32 
 
 
964 aa  129  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  24.21 
 
 
803 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  26.67 
 
 
800 aa  128  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  33.73 
 
 
891 aa  127  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.71 
 
 
1053 aa  127  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  31.52 
 
 
747 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.97 
 
 
826 aa  126  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  30.49 
 
 
794 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  29.43 
 
 
757 aa  125  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.62 
 
 
759 aa  124  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.08 
 
 
1023 aa  124  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 
911 aa  123  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4696  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.46 
 
 
847 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0792872  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  22.65 
 
 
928 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  29.35 
 
 
731 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 
856 aa  121  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
851 aa  121  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  29.77 
 
 
909 aa  121  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.4 
 
 
781 aa  120  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  24.8 
 
 
800 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  27.79 
 
 
1193 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  29.35 
 
 
1017 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  32.11 
 
 
744 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
947 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.51 
 
 
1016 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.54 
 
 
801 aa  119  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  26.67 
 
 
1032 aa  119  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.27 
 
 
726 aa  118  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  26.75 
 
 
962 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
812 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.59 
 
 
836 aa  116  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 
817 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  30.91 
 
 
822 aa  115  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
739 aa  115  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  28.89 
 
 
732 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  25.05 
 
 
836 aa  114  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.62 
 
 
759 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.62 
 
 
759 aa  114  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.62 
 
 
759 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
778 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  27.62 
 
 
759 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2470  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  28.21 
 
 
972 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0826406  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 
747 aa  112  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  29.41 
 
 
1055 aa  112  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  30.2 
 
 
791 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  32 
 
 
756 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  22.4 
 
 
765 aa  111  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  28.28 
 
 
977 aa  112  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 
760 aa  111  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  30.19 
 
 
711 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.53 
 
 
1058 aa  111  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  25.18 
 
 
820 aa  111  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 
1155 aa  111  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  28.41 
 
 
879 aa  111  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  27.56 
 
 
741 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
691 aa  111  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.81 
 
 
1059 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 
737 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  29.92 
 
 
739 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 
818 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
677 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 
755 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.01 
 
 
685 aa  108  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  25.7 
 
 
763 aa  108  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 
738 aa  108  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>