More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_06120 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 		 1003 aa  2101    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  39.72 
 
 		 1023 aa  669    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  42.08 
 
 		 952 aa  709    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  40.08 
 
 		 1017 aa  688    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  39.11 
 
 		 964 aa  621  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  37.13 
 
 		 1032 aa  609  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  37.9 
 
 		 1002 aa  604  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  37.6 
 
 		 1018 aa  601  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  36.93 
 
 		 1053 aa  597  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  34.13 
 
 		 1102 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 		 971 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  34.72 
 
 		 1193 aa  271  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.51 
 
 		 910 aa  230  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  25.68 
 
 		 945 aa  221  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  29.91 
 
 		 747 aa  189  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 745 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 		 747 aa  184  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.56 
 
 		 979 aa  183  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  27.5 
 
 		 794 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  28.15 
 
 		 744 aa  162  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.14 
 
 		 698 aa  159  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 		 803 aa  155  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  27.24 
 
 		 753 aa  155  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  28.54 
 
 		 791 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 		 781 aa  151  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.89 
 
 		 942 aa  150  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  26.98 
 
 		 756 aa  149  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 		 755 aa  147  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  26.15 
 
 		 807 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 803 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 		 729 aa  145  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 700 aa  145  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  29.3 
 
 		 898 aa  144  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.34 
 
 		 1139 aa  141  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  24.27 
 
 		 776 aa  140  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  25.7 
 
 		 739 aa  141  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 		 777 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.53 
 
 		 1143 aa  139  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  25.43 
 
 		 1135 aa  134  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 		 711 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  20.95 
 
 		 789 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.74 
 
 		 1148 aa  124  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  23.62 
 
 		 817 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  21.64 
 
 		 821 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 		 891 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  25.09 
 
 		 1138 aa  117  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  22.31 
 
 		 765 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 759 aa  117  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  35.33 
 
 		 749 aa  114  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  22.3 
 
 		 1155 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  21.79 
 
 		 981 aa  112  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  23.54 
 
 		 731 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  22.87 
 
 		 817 aa  108  5e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  24.49 
 
 		 927 aa  107  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  22.44 
 
 		 961 aa  106  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.37 
 
 		 871 aa  107  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 		 694 aa  105  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.67 
 
 		 734 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 		 1027 aa  103  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 		 747 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 		 738 aa  101  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  29.9 
 
 		 741 aa  101  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  31.87 
 
 		 761 aa  100  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 		 791 aa  100  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.33 
 
 		 730 aa  100  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.6 
 
 		 692 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 		 820 aa  99  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  21.66 
 
 		 979 aa  99  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  21.65 
 
 		 938 aa  98.6  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.92 
 
 		 722 aa  98.2  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 		 739 aa  98.2  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  24.12 
 
 		 876 aa  97.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.52 
 
 		 816 aa  97.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  21.78 
 
 		 805 aa  97.1  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  28 
 
 		 739 aa  96.7  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  27.14 
 
 		 760 aa  96.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 		 1055 aa  97.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  24.35 
 
 		 962 aa  96.3  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 764 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  29.61 
 
 		 947 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 		 764 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 		 764 aa  96.3  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 737 aa  95.5  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  21.8 
 
 		 805 aa  95.5  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 		 818 aa  94  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  27.53 
 
 		 1005 aa  94  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.33 
 
 		 824 aa  93.6  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  24.43 
 
 		 911 aa  92.8  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 738 aa  92.8  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.6 
 
 		 760 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 		 762 aa  92.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  22.57 
 
 		 851 aa  92.4  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.99 
 
 		 879 aa  92  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  23.44 
 
 		 856 aa  92  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.71 
 
 		 794 aa  91.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 		 764 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 		 731 aa  91.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 764 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 		 739 aa  91.7  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>