More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1175 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
962 aa  1997    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2470  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  31.6 
 
 
972 aa  418  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0826406  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1335  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  30.85 
 
 
996 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  29.61 
 
 
927 aa  389  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0194  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 
993 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0024  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  30.94 
 
 
951 aa  379  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
876 aa  241  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.78 
 
 
871 aa  233  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  26.17 
 
 
800 aa  218  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  24.81 
 
 
836 aa  213  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  31.1 
 
 
1027 aa  211  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
818 aa  211  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 
817 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0338  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
1154 aa  197  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000535715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  24.13 
 
 
821 aa  179  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24 
 
 
836 aa  177  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  22.94 
 
 
789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  23.87 
 
 
851 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.91 
 
 
864 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.03 
 
 
839 aa  171  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1971  nitrate reductase, alpha subunit  27.87 
 
 
1227 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2158  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  27.09 
 
 
1227 aa  168  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1932  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  27.09 
 
 
1227 aa  168  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1954  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  27.09 
 
 
1227 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3180  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  28.04 
 
 
1227 aa  168  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2135  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  28.04 
 
 
1227 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3399  nitrate reductase, alpha subunit  27.74 
 
 
1227 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2125  respiratory nitrate reductase subunit alpha  26.91 
 
 
1227 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.652044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1531  nitrate reductase, alpha subunit  32.49 
 
 
1227 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0970416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1907  nitrate reductase, alpha subunit  30.33 
 
 
1272 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  23.65 
 
 
822 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1977  respiratory nitrate reductase subunit alpha  26.91 
 
 
1227 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2275  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  27.68 
 
 
1227 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0499  nitrate reductase, alpha subunit  29.97 
 
 
1293 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.238766 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2635  nitrate reductase, alpha subunit  26.78 
 
 
1082 aa  164  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1987  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  24.72 
 
 
1227 aa  163  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.685241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1924  Nitrate reductase  31.38 
 
 
1181 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.05 
 
 
826 aa  161  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3864  nitrate reductase, alpha subunit  29 
 
 
1243 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5684  nitrate reductase, alpha subunit  30.16 
 
 
1252 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18720  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  26.68 
 
 
1256 aa  160  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2062  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  25.09 
 
 
1246 aa  160  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2128  nitrate reductase, alpha subunit  30.26 
 
 
1250 aa  160  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2592  nitrate reductase, alpha subunit  29.77 
 
 
1252 aa  158  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391444  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0314  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  26.2 
 
 
1236 aa  157  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.96 
 
 
813 aa  156  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.84 
 
 
792 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.74 
 
 
792 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1954  respiratory nitrate reductase alpha chain  25.73 
 
 
1254 aa  156  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0614297 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.74 
 
 
792 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4429  nitrate reductase, alpha subunit  27.09 
 
 
1225 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102054  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0250  nitrate reductase, alpha subunit  25.23 
 
 
1199 aa  155  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724701  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1510  nitrate reductase, alpha subunit  25.71 
 
 
1244 aa  154  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1263  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  27.15 
 
 
1227 aa  154  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1280  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  27.15 
 
 
1227 aa  154  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0762629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1755  nitrate reductase subunit alpha  24.95 
 
 
1246 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2226  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  25.45 
 
 
1254 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.459309  normal  0.0879237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2302  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  25.45 
 
 
1254 aa  154  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2634  nitrate reductase, alpha subunit  25.55 
 
 
1267 aa  154  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4236  nitrate reductase, alpha subunit  24.91 
 
 
1254 aa  153  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340769  normal  0.474216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0436  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.65 
 
 
1266 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1692  nitrate reductase, alpha subunit  24.95 
 
 
1246 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.821998 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1289  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  26.95 
 
 
1227 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0815258 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1584  nitrate reductase, alpha subunit  24.95 
 
 
1246 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1694  nitrate reductase, alpha subunit  24.95 
 
 
1246 aa  153  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3086  nitrate reductase, alpha subunit  24.25 
 
 
1247 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0427  nitrate reductase, alpha subunit  30.65 
 
 
1262 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0622693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1765  nitrate reductase subunit alpha  24.77 
 
 
1246 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.33 
 
 
793 aa  152  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3138  nitrate reductase, alpha subunit  31.45 
 
 
1221 aa  151  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000648615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0329  nitrate reductase, alpha subunit  31.78 
 
 
1191 aa  151  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.244606  hitchhiker  0.0000000648576 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0203  nitrate reductase, alpha subunit  28.57 
 
 
1191 aa  151  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1003  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  25.14 
 
 
1252 aa  151  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251874  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5213  nitrate reductase subunit alpha  29.2 
 
 
1216 aa  151  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598357  normal  0.703805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2156  nitrate reductase, alpha subunit  26.49 
 
 
1233 aa  150  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0115159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1109  nitrate reductase, alpha subunit  30.03 
 
 
1279 aa  150  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  31.21 
 
 
1232 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1346  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  28.93 
 
 
1240 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2259  nitrate reductase, alpha subunit  25.64 
 
 
1268 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2236  nitrate reductase, alpha subunit  24.91 
 
 
1247 aa  150  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2652  nitrate reductase, alpha subunit  27.25 
 
 
1193 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2706  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  29.01 
 
 
1245 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0398417  normal  0.0764072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13780  putative respiratory nitrate reductase alpha subun  25.09 
 
 
1261 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4546  nitrate reductase, alpha subunit  26.57 
 
 
1233 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159168  normal  0.282188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2564  nitrate reductase, alpha subunit  25.82 
 
 
1253 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4478  nitrate reductase, alpha subunit  30.28 
 
 
1242 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.397218 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  24.77 
 
 
1246 aa  149  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3675  nitrate reductase, alpha subunit  31.23 
 
 
1225 aa  149  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381887  normal  0.0436101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01438  hypothetical protein  24.77 
 
 
1246 aa  149  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  24.77 
 
 
1246 aa  149  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1234  nitrate reductase subunit alpha  24.73 
 
 
1261 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.251816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  24.77 
 
 
1256 aa  149  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  24.77 
 
 
1246 aa  149  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2078  nitrate reductase 2, alpha subunit  24.95 
 
 
1246 aa  149  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  24.73 
 
 
1246 aa  148  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1330  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  29.28 
 
 
1260 aa  148  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0900  nitrate reductase, alpha subunit  26.61 
 
 
1225 aa  148  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1376  nitrate reductase 1, alpha subunit  23.72 
 
 
1247 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0697293  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0661  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.77 
 
 
1275 aa  148  6e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.410277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1915  nitrate reductase 1, alpha subunit  23.77 
 
 
1247 aa  147  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0097675  normal  0.178347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>