More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0194 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0194  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
993 aa  2073    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  31.48 
 
 
927 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2470  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  30.56 
 
 
972 aa  440  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0826406  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1335  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  29.62 
 
 
996 aa  412  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0024  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  29.09 
 
 
951 aa  391  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  28.98 
 
 
962 aa  383  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 
1027 aa  235  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  32.84 
 
 
876 aa  210  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0250  nitrate reductase, alpha subunit  23.92 
 
 
1199 aa  198  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724701  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1003  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  24.88 
 
 
1252 aa  191  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251874  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  32.69 
 
 
871 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1987  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  23.14 
 
 
1227 aa  185  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.685241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0329  nitrate reductase, alpha subunit  27.63 
 
 
1191 aa  179  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.244606  hitchhiker  0.0000000648576 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0338  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 
1154 aa  176  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000535715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2275  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  23.49 
 
 
1227 aa  175  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  30.91 
 
 
817 aa  175  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  24.39 
 
 
851 aa  174  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2135  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  23.49 
 
 
1227 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3180  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  23.49 
 
 
1227 aa  174  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2158  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  29.59 
 
 
1227 aa  171  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1932  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  29.59 
 
 
1227 aa  171  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1954  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  29.59 
 
 
1227 aa  171  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1531  nitrate reductase, alpha subunit  30.03 
 
 
1227 aa  171  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0970416  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1977  respiratory nitrate reductase subunit alpha  29.21 
 
 
1227 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2125  respiratory nitrate reductase subunit alpha  23.13 
 
 
1227 aa  170  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.652044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25 
 
 
814 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25 
 
 
814 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25 
 
 
814 aa  170  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25 
 
 
814 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3399  nitrate reductase, alpha subunit  23.04 
 
 
1227 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25 
 
 
814 aa  169  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1971  nitrate reductase, alpha subunit  29.04 
 
 
1227 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1907  nitrate reductase, alpha subunit  30.9 
 
 
1272 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1924  Nitrate reductase  30.21 
 
 
1181 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 
818 aa  166  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.67 
 
 
826 aa  165  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.84 
 
 
836 aa  165  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2635  nitrate reductase, alpha subunit  25.47 
 
 
1082 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4478  nitrate reductase, alpha subunit  30.63 
 
 
1242 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.397218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2652  nitrate reductase, alpha subunit  26.79 
 
 
1193 aa  164  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0177  nitrate reductase, alpha subunit  30.47 
 
 
1232 aa  164  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.151114  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5441  Nitrate reductase  30.36 
 
 
1221 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0192  nitrate reductase, alpha subunit  28.49 
 
 
1232 aa  161  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5213  nitrate reductase subunit alpha  29.02 
 
 
1216 aa  160  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598357  normal  0.703805 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0499  nitrate reductase, alpha subunit  30.03 
 
 
1293 aa  160  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.238766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1491  nitrate reductase, alpha subunit  30.63 
 
 
1248 aa  159  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1346  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  28.77 
 
 
1240 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2592  nitrate reductase, alpha subunit  29.48 
 
 
1252 aa  158  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391444  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3864  nitrate reductase, alpha subunit  30.03 
 
 
1243 aa  158  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2128  nitrate reductase, alpha subunit  29.02 
 
 
1250 aa  158  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3675  nitrate reductase, alpha subunit  27.65 
 
 
1225 aa  157  7e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0381887  normal  0.0436101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18720  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  29.45 
 
 
1256 aa  157  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0314  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  28.53 
 
 
1236 aa  157  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3086  nitrate reductase, alpha subunit  30.64 
 
 
1247 aa  157  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1289  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  22.84 
 
 
1227 aa  157  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0815258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2040  nitrate reductase, alpha subunit  28.36 
 
 
1222 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4429  nitrate reductase, alpha subunit  27.76 
 
 
1225 aa  157  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102054  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.9 
 
 
814 aa  157  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  25.85 
 
 
1232 aa  157  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1954  respiratory nitrate reductase alpha chain  31.42 
 
 
1254 aa  157  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0614297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  23.9 
 
 
814 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.9 
 
 
814 aa  156  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.9 
 
 
814 aa  156  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  23.9 
 
 
814 aa  156  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2803  nitrate reductase, alpha subunit  29.07 
 
 
1259 aa  156  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00524212 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.9 
 
 
814 aa  156  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0510  molybdopterin oxidoreductase  29.5 
 
 
596 aa  156  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.464423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.9 
 
 
814 aa  156  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2634  nitrate reductase, alpha subunit  32.33 
 
 
1267 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.01 
 
 
814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1824  nitrate reductase, alpha subunit  27.85 
 
 
1255 aa  155  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1263  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  24.9 
 
 
1227 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3138  nitrate reductase, alpha subunit  27.87 
 
 
1221 aa  155  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000648615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1280  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  24.9 
 
 
1227 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0762629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0203  nitrate reductase, alpha subunit  30.37 
 
 
1191 aa  155  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  28.78 
 
 
821 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5684  nitrate reductase, alpha subunit  28.72 
 
 
1252 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.58 
 
 
814 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1763  nitrate reductase, alpha subunit  27.88 
 
 
1237 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0373025 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2236  nitrate reductase, alpha subunit  29.31 
 
 
1247 aa  152  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.829152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.95 
 
 
824 aa  152  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 
800 aa  151  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1205  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  27.94 
 
 
1216 aa  151  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2961  nitrate reductase, alpha subunit  28.94 
 
 
1229 aa  150  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2170  nitrate oxidoreductase alpha subunit  29.6 
 
 
1207 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1403  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  26.16 
 
 
1252 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3595  nitrate reductase, alpha subunit  25.66 
 
 
1201 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0172676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3449  nitrate reductase, alpha subunit  28.48 
 
 
1214 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1708  nitrate reductase, alpha subunit  29.26 
 
 
1208 aa  150  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1330  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  27.57 
 
 
1260 aa  149  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
789 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2706  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  30.11 
 
 
1245 aa  149  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0398417  normal  0.0764072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4546  nitrate reductase, alpha subunit  28.05 
 
 
1233 aa  149  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159168  normal  0.282188 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1545  nitrate reductase, alpha subunit  29.58 
 
 
1267 aa  149  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0122  nitrate reductase, alpha subunit  29.58 
 
 
1267 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1630  nitrate reductase, alpha subunit  29.58 
 
 
1267 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1249  nitrate reductase, alpha subunit  30.13 
 
 
1274 aa  148  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1900  nitrate reductase 1, alpha subunit  28.29 
 
 
1247 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0962174  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6464  nitrate reductase, alpha subunit  30.67 
 
 
1281 aa  148  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692114  normal  0.779302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2520  nitrate reductase, alpha subunit  29.91 
 
 
1251 aa  148  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.803235 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>