More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1335 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2470  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  78.49 
 
 
972 aa  1565    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0826406  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  41.86 
 
 
927 aa  711    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1335  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  100 
 
 
996 aa  2048    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0024  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  76.78 
 
 
951 aa  1514    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  37.03 
 
 
1027 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1708  nitrate reductase, alpha subunit  31.5 
 
 
1208 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2170  nitrate oxidoreductase alpha subunit  31.02 
 
 
1207 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1779  nitrate reductase, alpha subunit  30.94 
 
 
1208 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457562  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1907  nitrate reductase, alpha subunit  34.77 
 
 
1272 aa  434  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0194  molybdopterin oxidoreductase  29.71 
 
 
993 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1692  nitrate reductase, alpha subunit  34.24 
 
 
1246 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.821998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1755  nitrate reductase subunit alpha  34.57 
 
 
1246 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1694  nitrate reductase, alpha subunit  34.56 
 
 
1246 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318733 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1584  nitrate reductase, alpha subunit  34.24 
 
 
1246 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1765  nitrate reductase subunit alpha  34.12 
 
 
1246 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2564  nitrate reductase, alpha subunit  34.11 
 
 
1253 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0499  nitrate reductase, alpha subunit  34.69 
 
 
1293 aa  406  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.238766 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2315  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  33.21 
 
 
1247 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54501  normal  0.661113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01202  nitrate reductase 1, alpha subunit  32.55 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  33.62 
 
 
1246 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1915  nitrate reductase 1, alpha subunit  32.55 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0097675  normal  0.178347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1375  nitrate reductase, alpha subunit  32.55 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0266842  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1708  nitrate reductase 1, alpha subunit  32.55 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0699868  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1771  nitrate reductase, alpha subunit  34.4 
 
 
1255 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.654752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2259  nitrate reductase, alpha subunit  34.11 
 
 
1268 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2399  nitrate reductase, alpha subunit  32.55 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000859704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1334  nitrate reductase, alpha subunit  32.55 
 
 
1247 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00293612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  31.15 
 
 
962 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1853  nitrate reductase, alpha subunit  34.03 
 
 
1257 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.279909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2062  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  33.06 
 
 
1246 aa  402  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  33.5 
 
 
1256 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  33.37 
 
 
1246 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  33.37 
 
 
1246 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  33.37 
 
 
1246 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1987  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1227 aa  399  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.685241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0250  nitrate reductase, alpha subunit  34.08 
 
 
1199 aa  399  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724701  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2078  nitrate reductase 2, alpha subunit  33.5 
 
 
1246 aa  399  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1552  nitrate reductase, alpha subunit  33.5 
 
 
1246 aa  399  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01438  hypothetical protein  33.37 
 
 
1246 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2883  nitrate reductase, alpha subunit  33.7 
 
 
1240 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.912631  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1376  nitrate reductase 1, alpha subunit  33.21 
 
 
1247 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0697293  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2226  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  33.25 
 
 
1254 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.459309  normal  0.0879237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2302  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  33.25 
 
 
1254 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3086  nitrate reductase, alpha subunit  33.09 
 
 
1247 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0974  respiratory nitrate reductase alpha chain oxidoreductase protein  33.99 
 
 
1245 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.35672 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0122  nitrate reductase, alpha subunit  33.37 
 
 
1267 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1249  nitrate reductase, alpha subunit  33.25 
 
 
1274 aa  389  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5711  nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1281 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.539585 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4669  nitrate reductase, alpha subunit  33.18 
 
 
1245 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00847712  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6464  nitrate reductase, alpha subunit  33.37 
 
 
1281 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692114  normal  0.779302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1545  nitrate reductase, alpha subunit  33.25 
 
 
1267 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3592  nitrate reductase, alpha subunit  33.18 
 
 
1245 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.292866  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0329  nitrate reductase, alpha subunit  32.76 
 
 
1191 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.244606  hitchhiker  0.0000000648576 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1854  nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1341 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2706  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  33.58 
 
 
1245 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0398417  normal  0.0764072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2652  nitrate reductase, alpha subunit  32.71 
 
 
1193 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1630  nitrate reductase, alpha subunit  33.25 
 
 
1267 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1531  nitrate reductase, alpha subunit  33.46 
 
 
1227 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0970416  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5383  nitrate reductase, alpha subunit  32.84 
 
 
1258 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638499  normal  0.0486002 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1731  nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1248 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987036  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2757  nitrate reductase, alpha subunit  33.17 
 
 
1248 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1954  respiratory nitrate reductase alpha chain  32.27 
 
 
1254 aa  381  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0614297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0203  nitrate reductase, alpha subunit  33.09 
 
 
1191 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2241  nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1241 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3077  nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1241 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.49471  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2625  nitrate reductase, alpha subunit  33.17 
 
 
1241 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2681  nitrate reductase, alpha subunit  33.17 
 
 
1241 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1514  nitrate reductase, alpha subunit  33.29 
 
 
1241 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2520  nitrate reductase, alpha subunit  32.02 
 
 
1251 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.803235 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0275  nitrate reductase, alpha subunit  32.96 
 
 
1254 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2891  nitrate reductase, alpha subunit  33.33 
 
 
1254 aa  382  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0299  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  33.09 
 
 
1254 aa  379  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2592  nitrate reductase, alpha subunit  33.42 
 
 
1252 aa  379  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391444  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1491  nitrate reductase, alpha subunit  34.2 
 
 
1248 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5441  Nitrate reductase  34.8 
 
 
1221 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2128  nitrate reductase, alpha subunit  33.17 
 
 
1250 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.405432  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5002  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  32.88 
 
 
1244 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2634  nitrate reductase, alpha subunit  31.68 
 
 
1267 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1924  Nitrate reductase  35.45 
 
 
1181 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1205  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  34.43 
 
 
1216 aa  373  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1824  nitrate reductase, alpha subunit  34.12 
 
 
1255 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.527488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1403  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  32.55 
 
 
1252 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0951  nitrate reductase, alpha subunit  33.5 
 
 
1214 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13780  putative respiratory nitrate reductase alpha subun  31.53 
 
 
1261 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3864  nitrate reductase, alpha subunit  31.45 
 
 
1243 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2961  nitrate reductase, alpha subunit  32.57 
 
 
1229 aa  366  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1234  nitrate reductase subunit alpha  31.4 
 
 
1261 aa  366  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.251816  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0177  nitrate reductase, alpha subunit  33.25 
 
 
1232 aa  365  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.151114  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  29.75 
 
 
876 aa  364  4e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3449  nitrate reductase, alpha subunit  33.25 
 
 
1214 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230223  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0192  nitrate reductase, alpha subunit  33.5 
 
 
1232 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18720  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  32.9 
 
 
1256 aa  362  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0774  nitrate reductase, alpha subunit  33.42 
 
 
1214 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2068  nitrate reductase, alpha subunit  33.54 
 
 
1214 aa  363  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2040  nitrate reductase, alpha subunit  33.5 
 
 
1222 aa  362  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2635  nitrate reductase, alpha subunit  32.34 
 
 
1251 aa  361  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1510  nitrate reductase, alpha subunit  32.31 
 
 
1244 aa  360  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5213  nitrate reductase subunit alpha  34.09 
 
 
1216 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598357  normal  0.703805 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4478  nitrate reductase, alpha subunit  33.5 
 
 
1242 aa  358  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.397218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  31.87 
 
 
1232 aa  357  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>