More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2179 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2520  nitrate reductase, alpha subunit  68.54 
 
 		 1251 aa  1809    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.803235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01202  nitrate reductase 1, alpha subunit  78.77 
 
 		 1247 aa  2125    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01426  nitrate reductase 2 (NRZ), alpha subunit  100 
 
 		 1246 aa  2602    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2399  nitrate reductase, alpha subunit  78.77 
 
 		 1247 aa  2125    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000859704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2883  nitrate reductase, alpha subunit  78.77 
 
 		 1240 aa  2064    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.912631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3138  nitrate reductase, alpha subunit  49.72 
 
 		 1221 aa  1219    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000648615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5684  nitrate reductase, alpha subunit  67.53 
 
 		 1252 aa  1777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2179  nitrate reductase, alpha subunit  100 
 
 		 1246 aa  2602    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.615849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1971  nitrate reductase, alpha subunit  51.13 
 
 		 1227 aa  1310    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6184  nitrate reductase, alpha subunit  67.25 
 
 		 1264 aa  1783    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1987  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  49.88 
 
 		 1227 aa  1249    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.685241  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0974  respiratory nitrate reductase alpha chain oxidoreductase protein  65.49 
 
 		 1245 aa  1734    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.35672 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1692  nitrate reductase, alpha subunit  90.61 
 
 		 1246 aa  2401    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.821998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1959  nitrate reductase 1 subunit alpha  79.01 
 
 		 1247 aa  2128    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0299  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  67.38 
 
 		 1254 aa  1796    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1977  respiratory nitrate reductase subunit alpha  50.88 
 
 		 1227 aa  1301    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1954  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  51.05 
 
 		 1227 aa  1305    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1932  respiratory nitrate reductase, alpha subunit  50.96 
 
 		 1227 aa  1304    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1731  nitrate reductase, alpha subunit  65.68 
 
 		 1248 aa  1750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987036  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0605  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  67.28 
 
 		 1252 aa  1790    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1755  nitrate reductase subunit alpha  90.61 
 
 		 1246 aa  2400    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5002  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  65.92 
 
 		 1244 aa  1752    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1403  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  57.05 
 
 		 1252 aa  1469    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0774  nitrate reductase, alpha subunit  44.64 
 
 		 1214 aa  1035    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2068  nitrate reductase, alpha subunit  44.95 
 
 		 1214 aa  1043    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2757  nitrate reductase, alpha subunit  65.84 
 
 		 1248 aa  1753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1915  nitrate reductase 1, alpha subunit  78.77 
 
 		 1247 aa  2123    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0097675  normal  0.178347 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0122  nitrate reductase, alpha subunit  67.63 
 
 		 1267 aa  1780    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2592  nitrate reductase, alpha subunit  68.22 
 
 		 1252 aa  1797    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1334  nitrate reductase, alpha subunit  78.77 
 
 		 1247 aa  2125    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00293612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0192  nitrate reductase, alpha subunit  48.18 
 
 		 1232 aa  1183    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776544 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5383  nitrate reductase, alpha subunit  68.03 
 
 		 1258 aa  1808    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.638499  normal  0.0486002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0329  nitrate reductase, alpha subunit  46.82 
 
 		 1191 aa  1115    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.244606  hitchhiker  0.0000000648576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1020  nitrate oxidoreductase alpha subunit  48.47 
 
 		 1204 aa  1084    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0604019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2236  nitrate reductase, alpha subunit  70.46 
 
 		 1247 aa  1852    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829152 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2125  respiratory nitrate reductase subunit alpha  50.88 
 
 		 1227 aa  1300    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.652044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2634  nitrate reductase, alpha subunit  69.26 
 
 		 1267 aa  1846    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2188  nitrate reductase, alpha subunit  100 
 
 		 1246 aa  2602    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0203  nitrate reductase, alpha subunit  47.19 
 
 		 1191 aa  1116    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1249  nitrate reductase, alpha subunit  68.03 
 
 		 1274 aa  1788    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1954  respiratory nitrate reductase alpha chain  69.66 
 
 		 1254 aa  1861    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1854  nitrate reductase, alpha subunit  65.92 
 
 		 1341 aa  1759    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2170  nitrate oxidoreductase alpha subunit  48.97 
 
 		 1207 aa  1121    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1552  nitrate reductase, alpha subunit  99.6 
 
 		 1246 aa  2591    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2792  nitrate reductase, alpha subunit  67.75 
 
 		 1272 aa  1797    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835401  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4595  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  65.32 
 
 		 1296 aa  1767    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1330  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  72.01 
 
 		 1260 aa  1927    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0951  nitrate reductase, alpha subunit  44.48 
 
 		 1214 aa  1047    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2961  nitrate reductase, alpha subunit  44.64 
 
 		 1229 aa  1043    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.193329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1706  nitrate reductase 2, alpha subunit  99.44 
 
 		 1246 aa  2592    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3449  nitrate reductase, alpha subunit  44.32 
 
 		 1214 aa  1037    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.230223  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2074  respiratory nitrate reductase subunit alpha apoprotein  65.53 
 
 		 1252 aa  1750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.393838  normal  0.347657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2891  nitrate reductase, alpha subunit  68.06 
 
 		 1254 aa  1799    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6464  nitrate reductase, alpha subunit  68.35 
 
 		 1281 aa  1818    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.692114  normal  0.779302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1263  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  48.46 
 
 		 1227 aa  1173    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0905318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1205  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  53.33 
 
 		 1216 aa  1315    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2226  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  74.12 
 
 		 1254 aa  1990    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.459309  normal  0.0879237 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2302  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  74.04 
 
 		 1254 aa  1988    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1003  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  69.35 
 
 		 1252 aa  1838    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1375  nitrate reductase, alpha subunit  78.77 
 
 		 1247 aa  2125    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0266842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1649  nitrate reductase, alpha subunit  99.76 
 
 		 1256 aa  2597    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2706  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  66.56 
 
 		 1245 aa  1761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0398417  normal  0.0764072 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5711  nitrate reductase, alpha subunit  68.38 
 
 		 1281 aa  1816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.539585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13780  putative respiratory nitrate reductase alpha subun  70.21 
 
 		 1261 aa  1868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0314  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  48.06 
 
 		 1236 aa  1158    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2652  nitrate reductase, alpha subunit  47.27 
 
 		 1193 aa  1136    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4669  nitrate reductase, alpha subunit  65.65 
 
 		 1245 aa  1736    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00847712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0509  molydopterin dinucleotide-binding region  49.12 
 
 		 628 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0250  nitrate reductase, alpha subunit  47.82 
 
 		 1199 aa  1110    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1109  nitrate reductase, alpha subunit  66.46 
 
 		 1279 aa  1795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4236  nitrate reductase, alpha subunit  67.53 
 
 		 1254 aa  1762    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.340769  normal  0.474216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1346  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  48.1 
 
 		 1240 aa  1198    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1280  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  48.46 
 
 		 1227 aa  1173    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0762629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4546  nitrate reductase, alpha subunit  47.94 
 
 		 1233 aa  1165    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159168  normal  0.282188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3086  nitrate reductase, alpha subunit  74.26 
 
 		 1247 aa  2008    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0661  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  68.07 
 
 		 1275 aa  1800    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3761  nitrate reductase, alpha subunit  65.75 
 
 		 1276 aa  1774    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0436  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  67.9 
 
 		 1266 aa  1816    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2241  nitrate reductase, alpha subunit  65.68 
 
 		 1241 aa  1750    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.470628  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1708  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  67.01 
 
 		 1268 aa  1784    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773646 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3077  nitrate reductase, alpha subunit  65.68 
 
 		 1241 aa  1750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.49471  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1907  nitrate reductase, alpha subunit  47.31 
 
 		 1272 aa  1160    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2625  nitrate reductase, alpha subunit  65.76 
 
 		 1241 aa  1752    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3595  nitrate reductase, alpha subunit  45.3 
 
 		 1201 aa  1011    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0172676 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1630  nitrate reductase, alpha subunit  67.63 
 
 		 1267 aa  1782    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2681  nitrate reductase, alpha subunit  65.84 
 
 		 1241 aa  1753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3399  nitrate reductase, alpha subunit  50.8 
 
 		 1227 aa  1301    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1289  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  48.38 
 
 		 1227 aa  1169    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0815258 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1545  nitrate reductase, alpha subunit  67.79 
 
 		 1267 aa  1782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1514  nitrate reductase, alpha subunit  65.68 
 
 		 1241 aa  1750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.484063  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2156  nitrate reductase, alpha subunit  47.86 
 
 		 1233 aa  1154    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0115159 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0499  nitrate reductase, alpha subunit  46.47 
 
 		 1293 aa  1135    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.238766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0177  nitrate reductase, alpha subunit  48.09 
 
 		 1232 aa  1188    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.151114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3864  nitrate reductase, alpha subunit  67.29 
 
 		 1243 aa  1748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2062  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  88.36 
 
 		 1246 aa  2340    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2315  respiratory nitrate reductase alpha subunit apoprotein  78.53 
 
 		 1247 aa  2122    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54501  normal  0.661113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1581  nitrate reductase, alpha subunit  66.99 
 
 		 1244 aa  1745    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0275  nitrate reductase, alpha subunit  67.22 
 
 		 1254 aa  1792    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11186  respiratory nitrate reductase alpha subunit narG  46.76 
 
 		 1232 aa  1149    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.109076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1895  nitrate reductase 1, alpha subunit  79.01 
 
 		 1247 aa  2128    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.5069  normal  0.259133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>