More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_20860 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  46.42 
 
 
898 aa  782    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  39.63 
 
 
945 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  100 
 
 
942 aa  1958    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  45.36 
 
 
910 aa  778    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  38.27 
 
 
979 aa  599  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
971 aa  292  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
745 aa  277  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  28.02 
 
 
952 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16890  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.35 
 
 
1018 aa  237  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
817 aa  231  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.94 
 
 
807 aa  225  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  26.21 
 
 
964 aa  221  6e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.88 
 
 
824 aa  212  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 
803 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 
747 aa  207  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  25.28 
 
 
836 aa  204  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  24.71 
 
 
803 aa  202  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 
1155 aa  199  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  25.69 
 
 
821 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  30.63 
 
 
1102 aa  196  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.4 
 
 
836 aa  195  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.29 
 
 
781 aa  194  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 
765 aa  194  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  25.65 
 
 
791 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.17 
 
 
857 aa  189  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  24.45 
 
 
739 aa  187  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  25.6 
 
 
1138 aa  186  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.11 
 
 
839 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.52 
 
 
934 aa  180  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  40.23 
 
 
777 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
818 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 
729 aa  174  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 
961 aa  174  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 
822 aa  173  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.35 
 
 
813 aa  173  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  24.11 
 
 
820 aa  171  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
1148 aa  170  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 
800 aa  170  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 
789 aa  168  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.27 
 
 
826 aa  167  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 
784 aa  167  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  24.79 
 
 
756 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  27.45 
 
 
1002 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.3924 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  33.08 
 
 
747 aa  166  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  36.08 
 
 
794 aa  164  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.54 
 
 
1053 aa  163  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3031  molydopterin dinucleotide-binding region  33.54 
 
 
1193 aa  161  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 
851 aa  161  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  37.3 
 
 
776 aa  161  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  34.23 
 
 
726 aa  159  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 
800 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.16 
 
 
864 aa  156  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  34.77 
 
 
753 aa  155  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  34.24 
 
 
730 aa  155  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  21.52 
 
 
981 aa  154  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 
911 aa  153  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  24.88 
 
 
1032 aa  152  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02110  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.31 
 
 
806 aa  152  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292195  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  29.2 
 
 
969 aa  152  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06120  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.89 
 
 
1003 aa  151  6e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 
917 aa  150  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  34.96 
 
 
759 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  32.81 
 
 
744 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  33.55 
 
 
731 aa  149  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  23.33 
 
 
856 aa  149  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.16 
 
 
801 aa  149  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  23.71 
 
 
856 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  33.59 
 
 
891 aa  147  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0471  molydopterin dinucleotide-binding region  32.92 
 
 
1017 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  32.16 
 
 
1023 aa  147  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 
804 aa  146  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.36 
 
 
978 aa  146  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.33 
 
 
981 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 
729 aa  144  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  22.75 
 
 
817 aa  144  6e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27 
 
 
953 aa  144  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  33.47 
 
 
744 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  32.16 
 
 
711 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
938 aa  141  4.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 
778 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  31.35 
 
 
947 aa  141  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 
812 aa  140  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  24.24 
 
 
1058 aa  140  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  23.84 
 
 
1142 aa  138  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  31.33 
 
 
731 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.02 
 
 
1061 aa  138  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  32.79 
 
 
755 aa  138  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 
1062 aa  137  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.95 
 
 
1010 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  29.18 
 
 
741 aa  137  9e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.26 
 
 
1016 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.98 
 
 
698 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  28.06 
 
 
747 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 
1065 aa  137  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.41 
 
 
730 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  31.96 
 
 
722 aa  136  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  30.3 
 
 
711 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
739 aa  136  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>