More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1197 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  37.67 
 
 
1084 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
934 aa  1941    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  35.87 
 
 
1074 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  35.15 
 
 
992 aa  589  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  35.57 
 
 
1070 aa  572  1e-161  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  35.27 
 
 
1070 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 
1033 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  35.17 
 
 
1031 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  32.44 
 
 
1030 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  32.3 
 
 
1022 aa  478  1e-133  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  32.92 
 
 
1020 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  32.92 
 
 
1020 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  33.93 
 
 
1087 aa  468  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  32.71 
 
 
1020 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  32.81 
 
 
1020 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  32.81 
 
 
1020 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  33.26 
 
 
1064 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  33.06 
 
 
1064 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  32 
 
 
1027 aa  449  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  31.26 
 
 
1035 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  31.57 
 
 
1029 aa  443  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  31.47 
 
 
1035 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  31.06 
 
 
1035 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  30 
 
 
1036 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 
1035 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  30.99 
 
 
1035 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  31.97 
 
 
1011 aa  429  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  30.54 
 
 
1066 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  30.79 
 
 
1035 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  31.98 
 
 
1038 aa  413  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  30.5 
 
 
996 aa  404  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  29.46 
 
 
1012 aa  365  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  29.39 
 
 
1024 aa  365  3e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  27.44 
 
 
1173 aa  355  2e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  29.39 
 
 
1012 aa  350  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  28.65 
 
 
1026 aa  335  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  24.95 
 
 
879 aa  218  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 
856 aa  194  6e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
858 aa  192  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.23 
 
 
953 aa  187  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  23.97 
 
 
843 aa  184  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.24 
 
 
968 aa  183  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  24.29 
 
 
961 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.65 
 
 
969 aa  181  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.24 
 
 
973 aa  180  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  24.3 
 
 
800 aa  178  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 
817 aa  178  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
812 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.38 
 
 
923 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  23.85 
 
 
958 aa  174  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  22.65 
 
 
978 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.58 
 
 
942 aa  172  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  24.12 
 
 
932 aa  170  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  22.61 
 
 
978 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  22.98 
 
 
974 aa  167  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 
974 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 
854 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 
854 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.42 
 
 
973 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  23.42 
 
 
973 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  23.42 
 
 
973 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.42 
 
 
978 aa  164  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.42 
 
 
978 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.42 
 
 
973 aa  164  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.96 
 
 
981 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  25.14 
 
 
821 aa  163  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.32 
 
 
973 aa  162  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 
789 aa  161  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.07 
 
 
978 aa  161  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  23.69 
 
 
851 aa  160  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  33.04 
 
 
764 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  32.54 
 
 
764 aa  159  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 
764 aa  159  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.66 
 
 
824 aa  158  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  34.23 
 
 
760 aa  158  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  33.43 
 
 
760 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  32.54 
 
 
760 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  22.23 
 
 
856 aa  157  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  33.43 
 
 
764 aa  157  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.66 
 
 
935 aa  156  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  32.93 
 
 
764 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  22.86 
 
 
981 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.01 
 
 
839 aa  154  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.32 
 
 
857 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.74 
 
 
974 aa  152  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  31.36 
 
 
760 aa  151  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.74 
 
 
855 aa  150  8e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  23.38 
 
 
866 aa  150  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 
928 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  31.86 
 
 
758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 
805 aa  149  3e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  23.03 
 
 
817 aa  148  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.91 
 
 
928 aa  148  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  31.4 
 
 
757 aa  146  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 
805 aa  145  3e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  31.66 
 
 
760 aa  145  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  34.62 
 
 
754 aa  145  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  33.33 
 
 
760 aa  144  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  22.01 
 
 
979 aa  143  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  22.52 
 
 
781 aa  141  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>