More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_111 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  93.8 
 
 		 1033 aa  2017    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  90.74 
 
 		 1070 aa  2026    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  100 
 
 		 1070 aa  2219    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50.64 
 
 		 1084 aa  1087    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  47.87 
 
 		 1074 aa  1019    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  35.57 
 
 		 934 aa  578  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  32.76 
 
 		 1087 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  32.34 
 
 		 1031 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  28.93 
 
 		 992 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  30.75 
 
 		 1038 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  29.16 
 
 		 1020 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  28.98 
 
 		 1020 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  28.98 
 
 		 1020 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  29.07 
 
 		 1020 aa  399  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  28.89 
 
 		 1020 aa  398  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  29.22 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  29.28 
 
 		 1027 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 		 1022 aa  382  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  28.64 
 
 		 1030 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  29.87 
 
 		 1011 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  29.41 
 
 		 1066 aa  368  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  29.12 
 
 		 1064 aa  363  7.0000000000000005e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  29.23 
 
 		 1064 aa  362  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  28.3 
 
 		 1035 aa  351  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  27.56 
 
 		 1173 aa  347  1e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  28.02 
 
 		 1035 aa  343  9e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 		 1035 aa  337  9e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  27.76 
 
 		 1035 aa  336  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  27.4 
 
 		 1035 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  27.6 
 
 		 1035 aa  332  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  27.65 
 
 		 1036 aa  331  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  26.92 
 
 		 996 aa  327  9e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  26.34 
 
 		 1012 aa  266  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  26.65 
 
 		 1012 aa  262  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  26.11 
 
 		 1026 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  25.95 
 
 		 1024 aa  253  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.59 
 
 		 856 aa  108  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  24.12 
 
 		 978 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.01 
 
 		 953 aa  99  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.78 
 
 		 812 aa  98.6  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 969 aa  97.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  23.95 
 
 		 833 aa  97.4  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 817 aa  95.9  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 		 981 aa  94.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 		 974 aa  93.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 		 978 aa  93.6  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.07 
 
 		 978 aa  92.8  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 		 973 aa  92.8  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 		 973 aa  92.8  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  24.02 
 
 		 978 aa  92  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.07 
 
 		 978 aa  91.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.07 
 
 		 973 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.07 
 
 		 973 aa  91.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 		 973 aa  91.7  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24.28 
 
 		 974 aa  89.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.61 
 
 		 917 aa  89  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.37 
 
 		 974 aa  89.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.67 
 
 		 923 aa  88.2  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  24.49 
 
 		 822 aa  88.2  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 		 961 aa  86.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.52 
 
 		 928 aa  83.2  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  24.19 
 
 		 968 aa  82  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 		 826 aa  82  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 		 876 aa  80.5  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  23.65 
 
 		 879 aa  80.1  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.78 
 
 		 973 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  22.7 
 
 		 858 aa  79.3  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 		 979 aa  79.7  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  23.61 
 
 		 817 aa  77.4  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  32.03 
 
 		 945 aa  77.4  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.68 
 
 		 981 aa  77.4  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  23.08 
 
 		 958 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  23.51 
 
 		 781 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 1058 aa  76.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 		 805 aa  76.3  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.3 
 
 		 935 aa  75.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 		 932 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  25.16 
 
 		 932 aa  75.5  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  22.45 
 
 		 879 aa  75.1  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  27.41 
 
 		 760 aa  74.7  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  24.6 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07940  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.5 
 
 		 834 aa  74.3  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  31.69 
 
 		 759 aa  73.9  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.19 
 
 		 864 aa  73.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.93 
 
 		 1010 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.12 
 
 		 898 aa  73.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 739 aa  73.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  23.14 
 
 		 777 aa  72.8  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  34.65 
 
 		 910 aa  71.2  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  22.96 
 
 		 818 aa  71.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 		 760 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.28 
 
 		 836 aa  70.9  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  24.57 
 
 		 1065 aa  70.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 		 938 aa  70.5  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  28.57 
 
 		 1434 aa  69.3  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  31.33 
 
 		 734 aa  69.3  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 		 916 aa  68.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  26.12 
 
 		 909 aa  68.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>