More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0633 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  88.79 
 
 		 1035 aa  1947    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  49.57 
 
 		 1020 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  49.95 
 
 		 1020 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  47.56 
 
 		 1038 aa  934    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  49.95 
 
 		 1020 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  54.26 
 
 		 1030 aa  1172    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  37.63 
 
 		 1031 aa  693    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  42.38 
 
 		 996 aa  763    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  49.33 
 
 		 1029 aa  1035    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 1035 aa  2149    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  49.95 
 
 		 1020 aa  1004    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  50.74 
 
 		 1027 aa  1012    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  49.71 
 
 		 1066 aa  979    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  39.52 
 
 		 1011 aa  679    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  98.45 
 
 		 1035 aa  2121    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  88.89 
 
 		 1035 aa  1949    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  41.63 
 
 		 1022 aa  809    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  49.07 
 
 		 1064 aa  978    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  49.17 
 
 		 1064 aa  977    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  49.95 
 
 		 1020 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  88.32 
 
 		 1036 aa  1936    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  88.89 
 
 		 1035 aa  1951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  89.26 
 
 		 1035 aa  1954    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  36.7 
 
 		 1024 aa  631  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  36.42 
 
 		 1026 aa  632  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  34 
 
 		 1012 aa  581  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  33.65 
 
 		 1012 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  31.08 
 
 		 992 aa  479  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  30.79 
 
 		 934 aa  431  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.68 
 
 		 1084 aa  387  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.36 
 
 		 1070 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 		 1033 aa  344  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  28.02 
 
 		 1070 aa  343  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 		 1074 aa  322  3e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  28.48 
 
 		 1087 aa  321  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  28.05 
 
 		 1173 aa  274  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 		 856 aa  131  6e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  23.14 
 
 		 958 aa  128  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.98 
 
 		 974 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 		 817 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  21.47 
 
 		 968 aa  118  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.19 
 
 		 923 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.25 
 
 		 928 aa  117  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.23 
 
 		 935 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  23.63 
 
 		 981 aa  112  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.89 
 
 		 973 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  22.35 
 
 		 932 aa  109  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.07 
 
 		 953 aa  108  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  24.02 
 
 		 979 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  20.42 
 
 		 1014 aa  102  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.03 
 
 		 981 aa  99.8  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  22.99 
 
 		 978 aa  99  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.37 
 
 		 812 aa  97.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  21.89 
 
 		 969 aa  96.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  24.76 
 
 		 955 aa  95.9  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  21.43 
 
 		 858 aa  96.3  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  24.53 
 
 		 951 aa  96.3  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.61 
 
 		 898 aa  94.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  24.26 
 
 		 953 aa  92  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.81 
 
 		 978 aa  91.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.81 
 
 		 973 aa  91.7  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  22.81 
 
 		 973 aa  91.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  22.81 
 
 		 973 aa  91.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.81 
 
 		 973 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  22.81 
 
 		 973 aa  91.3  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.81 
 
 		 978 aa  91.3  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  22.21 
 
 		 978 aa  90.9  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 		 818 aa  90.5  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 		 745 aa  89.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  23.62 
 
 		 952 aa  88.6  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  20.71 
 
 		 917 aa  87.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  21.49 
 
 		 971 aa  86.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.36 
 
 		 722 aa  86.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  23.61 
 
 		 953 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.6 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  22.78 
 
 		 974 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 		 756 aa  83.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  22.44 
 
 		 974 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 		 1087 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  20.82 
 
 		 978 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 		 961 aa  82.4  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  20.85 
 
 		 1016 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  23.23 
 
 		 805 aa  82  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.1 
 
 		 750 aa  82  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  21.81 
 
 		 967 aa  82  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.35 
 
 		 824 aa  81.6  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  23.18 
 
 		 994 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  22.95 
 
 		 805 aa  80.9  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 1073 aa  80.9  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  26.43 
 
 		 726 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.08 
 
 		 891 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  22.94 
 
 		 777 aa  79.7  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 		 800 aa  78.6  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 		 760 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  21.27 
 
 		 910 aa  76.6  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  23.2 
 
 		 977 aa  76.6  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  22.06 
 
 		 1127 aa  76.3  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  22.55 
 
 		 803 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  22.49 
 
 		 953 aa  76.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  21.81 
 
 		 760 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>