More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1959 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  99.02 
 
 
1020 aa  2088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  47.01 
 
 
1038 aa  923    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  99.12 
 
 
1020 aa  2090    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  36.45 
 
 
1031 aa  655    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  64.07 
 
 
1027 aa  1319    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  39.45 
 
 
1011 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  53.85 
 
 
1029 aa  1181    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  49.57 
 
 
1035 aa  1003    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  50.05 
 
 
1035 aa  1024    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  100 
 
 
1020 aa  2108    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  50.34 
 
 
1035 aa  1028    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  99.31 
 
 
1020 aa  2095    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  50.05 
 
 
1030 aa  1068    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  49.28 
 
 
1035 aa  1003    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  99.12 
 
 
1020 aa  2088    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  50.34 
 
 
1035 aa  1027    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  47.89 
 
 
1064 aa  958    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  47.8 
 
 
1064 aa  954    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  49.9 
 
 
1036 aa  1015    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  41.09 
 
 
996 aa  714    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  50.05 
 
 
1066 aa  986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  49.57 
 
 
1035 aa  1013    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  40.95 
 
 
1022 aa  775    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  35.52 
 
 
1026 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  34.65 
 
 
1024 aa  594  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  34.39 
 
 
1012 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  34.05 
 
 
1012 aa  561  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  32.92 
 
 
934 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  32.47 
 
 
992 aa  474  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.06 
 
 
1084 aa  426  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.39 
 
 
1070 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 
1074 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 
1033 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  29.34 
 
 
1070 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  28.32 
 
 
1087 aa  330  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  28.12 
 
 
1173 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.17 
 
 
978 aa  137  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 
856 aa  137  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 
812 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.69 
 
 
953 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.32 
 
 
923 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.47 
 
 
973 aa  132  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.18 
 
 
928 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.33 
 
 
974 aa  131  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  24.93 
 
 
932 aa  128  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.16 
 
 
969 aa  127  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  22.22 
 
 
968 aa  127  9e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  24.04 
 
 
958 aa  126  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 
961 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
817 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  21.51 
 
 
977 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 
974 aa  120  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  23.6 
 
 
974 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.76 
 
 
973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.76 
 
 
978 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.76 
 
 
973 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.76 
 
 
973 aa  119  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.58 
 
 
978 aa  118  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.58 
 
 
973 aa  118  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.58 
 
 
973 aa  118  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.68 
 
 
898 aa  117  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.76 
 
 
978 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  22.99 
 
 
978 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  21.24 
 
 
955 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  21.94 
 
 
953 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  24.01 
 
 
981 aa  115  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.3 
 
 
729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.49 
 
 
979 aa  112  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.11 
 
 
981 aa  110  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  21.57 
 
 
953 aa  110  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.64 
 
 
910 aa  106  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.64 
 
 
935 aa  95.5  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.44 
 
 
942 aa  94.7  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  23.68 
 
 
945 aa  94.7  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  25.42 
 
 
952 aa  94.7  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  24.26 
 
 
951 aa  94.4  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  23.27 
 
 
866 aa  93.2  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.33 
 
 
722 aa  92.8  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 
764 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 
764 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 
760 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.71 
 
 
760 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.6 
 
 
764 aa  88.6  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
764 aa  88.6  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  24.27 
 
 
994 aa  88.6  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
764 aa  88.6  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
1087 aa  87.8  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 
726 aa  87.8  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.32 
 
 
760 aa  87.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 
805 aa  87.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 
805 aa  87.4  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  21.07 
 
 
1014 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 
947 aa  87  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.51 
 
 
826 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
745 aa  86.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  23.77 
 
 
1016 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.97 
 
 
760 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.57 
 
 
758 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 
760 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  21 
 
 
1073 aa  85.5  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>