More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3982 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  38.17 
 
 		 1012 aa  722    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  37.57 
 
 		 1029 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 1026 aa  2152    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  37.94 
 
 		 1012 aa  720    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  82.07 
 
 		 1024 aa  1787    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  35.75 
 
 		 1030 aa  648    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  36.42 
 
 		 1035 aa  634  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  36.42 
 
 		 1035 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  36.1 
 
 		 1035 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  36 
 
 		 1035 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  35.81 
 
 		 1035 aa  629  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  36.97 
 
 		 1035 aa  625  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  36.5 
 
 		 1064 aa  619  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  36.86 
 
 		 1027 aa  622  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  35.84 
 
 		 1038 aa  618  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  36.5 
 
 		 1064 aa  617  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  36.49 
 
 		 1036 aa  619  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  35.62 
 
 		 1020 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  35.62 
 
 		 1020 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  35.62 
 
 		 1020 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  35.71 
 
 		 1020 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  35.52 
 
 		 1020 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  34.62 
 
 		 1066 aa  602  1e-170  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  35.11 
 
 		 1022 aa  585  1.0000000000000001e-165  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  34.43 
 
 		 996 aa  568  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  30.67 
 
 		 1031 aa  483  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  31.21 
 
 		 1011 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  28.96 
 
 		 992 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 934 aa  342  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.72 
 
 		 1070 aa  278  5e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 		 1033 aa  271  4e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.85 
 
 		 1084 aa  271  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  26.18 
 
 		 1070 aa  262  3e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 		 1074 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  24.64 
 
 		 1173 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  25.23 
 
 		 1087 aa  245  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 		 856 aa  107  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  22.16 
 
 		 817 aa  98.2  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 812 aa  97.4  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  20.67 
 
 		 953 aa  91.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.93 
 
 		 928 aa  89.4  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  20.3 
 
 		 958 aa  86.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 		 739 aa  85.1  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  22.73 
 
 		 969 aa  84.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  23.12 
 
 		 1065 aa  84.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  23.01 
 
 		 1062 aa  84  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.62 
 
 		 973 aa  82  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.64 
 
 		 981 aa  81.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 		 1058 aa  82  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  23.01 
 
 		 898 aa  81.6  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  22.5 
 
 		 1058 aa  80.9  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 		 737 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  21.34 
 
 		 910 aa  79.3  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  29.29 
 
 		 738 aa  79.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  24.27 
 
 		 1155 aa  78.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  22.82 
 
 		 818 aa  78.2  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  24.09 
 
 		 955 aa  78.2  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 		 745 aa  76.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  23.43 
 
 		 952 aa  75.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  21.75 
 
 		 953 aa  74.7  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  22.97 
 
 		 777 aa  74.3  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.34 
 
 		 923 aa  73.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.88 
 
 		 942 aa  73.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  22.42 
 
 		 817 aa  72.4  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  22.77 
 
 		 953 aa  72  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  24.01 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  20.3 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 756 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  22.08 
 
 		 778 aa  71.2  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  29.71 
 
 		 722 aa  71.2  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  22.2 
 
 		 978 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  20.96 
 
 		 917 aa  70.9  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  22.44 
 
 		 951 aa  71.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  22.4 
 
 		 981 aa  70.5  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.01 
 
 		 978 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.87 
 
 		 973 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.87 
 
 		 973 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.01 
 
 		 973 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  23.01 
 
 		 973 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  22.87 
 
 		 973 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.87 
 
 		 978 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  21.43 
 
 		 1016 aa  68.9  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.63 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  23.09 
 
 		 913 aa  68.6  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  22.21 
 
 		 858 aa  67.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.63 
 
 		 764 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 		 764 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 		 764 aa  67.4  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.59 
 
 		 864 aa  66.6  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  19.76 
 
 		 935 aa  66.6  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  25.75 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  25.75 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  25 
 
 		 757 aa  66.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  26.67 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  25.75 
 
 		 758 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  22.86 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1011  molybdopterin oxidoreductase  22.89 
 
 		 787 aa  65.9  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0550449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  23.13 
 
 		 911 aa  65.1  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>