More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1508 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  84.91 
 
 
1062 aa  1890    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  82.25 
 
 
1058 aa  1823    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  83.85 
 
 
1065 aa  1849    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
1058 aa  2164    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  29.77 
 
 
856 aa  206  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
817 aa  193  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
812 aa  190  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
932 aa  174  6.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.91 
 
 
927 aa  170  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  26.83 
 
 
930 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
938 aa  167  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  23.96 
 
 
928 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 
805 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  27.62 
 
 
805 aa  163  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  27.54 
 
 
909 aa  157  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 
916 aa  157  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.96 
 
 
910 aa  148  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 
803 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  29.02 
 
 
789 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.24 
 
 
807 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 
803 aa  140  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.78 
 
 
942 aa  139  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 
765 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.49 
 
 
898 aa  133  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.75 
 
 
969 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.5 
 
 
953 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
876 aa  125  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.42 
 
 
781 aa  124  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  24.7 
 
 
836 aa  124  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.9 
 
 
836 aa  122  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  25 
 
 
978 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.3 
 
 
973 aa  121  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  25.3 
 
 
973 aa  121  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1588  molydopterin dinucleotide-binding region  23.19 
 
 
945 aa  120  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0385421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.77 
 
 
978 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.77 
 
 
973 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.86 
 
 
974 aa  119  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  24.46 
 
 
961 aa  119  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.85 
 
 
973 aa  118  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  28.19 
 
 
784 aa  118  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 
974 aa  118  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.54 
 
 
973 aa  118  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.29 
 
 
981 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  25.89 
 
 
978 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 
764 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  24.59 
 
 
817 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.74 
 
 
824 aa  114  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  27.13 
 
 
761 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 
978 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 
981 aa  113  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
974 aa  111  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 
851 aa  112  6e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.62 
 
 
722 aa  111  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
807 aa  111  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  26.81 
 
 
968 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.81 
 
 
839 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.14 
 
 
979 aa  109  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.533202  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  21.93 
 
 
1155 aa  109  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  25.37 
 
 
979 aa  108  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 
971 aa  108  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  23.13 
 
 
821 aa  107  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  23.11 
 
 
1138 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.72 
 
 
934 aa  107  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
978 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  26.48 
 
 
757 aa  107  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0250  nitrate reductase, alpha subunit  28.65 
 
 
1199 aa  107  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724701  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
800 aa  106  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  29.72 
 
 
711 aa  106  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
729 aa  106  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  27.14 
 
 
858 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  27.11 
 
 
711 aa  105  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
759 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  23.54 
 
 
820 aa  104  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  28.21 
 
 
758 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  21.94 
 
 
1148 aa  103  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  28.21 
 
 
758 aa  103  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.47 
 
 
730 aa  103  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.71 
 
 
826 aa  103  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  28.75 
 
 
758 aa  102  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  28.21 
 
 
758 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  26.56 
 
 
758 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  28.21 
 
 
758 aa  102  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.89 
 
 
1061 aa  101  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 
800 aa  101  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.41 
 
 
744 aa  101  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  24.17 
 
 
1142 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  28.03 
 
 
804 aa  100  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 
731 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.91 
 
 
928 aa  100  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.77 
 
 
813 aa  100  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.51 
 
 
1012 aa  99  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.32 
 
 
1009 aa  98.6  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.35 
 
 
1012 aa  96.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.74 
 
 
864 aa  96.3  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  25.96 
 
 
732 aa  96.3  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 
739 aa  96.3  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  22.64 
 
 
822 aa  95.5  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  26.47 
 
 
731 aa  95.1  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  25.07 
 
 
1014 aa  94.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.43 
 
 
760 aa  95.1  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>