More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0267 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  90.5 
 
 
1033 aa  1961    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50.82 
 
 
1084 aa  1085    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  90.74 
 
 
1070 aa  2028    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
1070 aa  2224    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  47.31 
 
 
1074 aa  1018    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 
934 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  30.79 
 
 
992 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  32.33 
 
 
1087 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  32.13 
 
 
1031 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  30.83 
 
 
1038 aa  436  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  29.86 
 
 
1020 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  30.12 
 
 
1020 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  29.86 
 
 
1020 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  29.95 
 
 
1020 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  29.77 
 
 
1020 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  29.62 
 
 
1029 aa  405  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  29.4 
 
 
1027 aa  388  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  29.5 
 
 
1022 aa  387  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  28.76 
 
 
1030 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  29.32 
 
 
1066 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  29.46 
 
 
1011 aa  376  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  29.15 
 
 
1064 aa  364  6e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  29.06 
 
 
1064 aa  364  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  29.61 
 
 
1035 aa  362  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  29.52 
 
 
1035 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  27.58 
 
 
1173 aa  353  7e-96  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  28.85 
 
 
1035 aa  351  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
1035 aa  350  7e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  28.67 
 
 
1035 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  28.87 
 
 
1035 aa  347  7e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  28.73 
 
 
1036 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  25.85 
 
 
996 aa  322  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  26.82 
 
 
1012 aa  278  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  26.68 
 
 
1012 aa  277  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  26.72 
 
 
1026 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  26.93 
 
 
1024 aa  269  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 
856 aa  108  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
817 aa  103  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
812 aa  100  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  24.81 
 
 
833 aa  96.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  22.31 
 
 
866 aa  95.5  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.53 
 
 
969 aa  95.5  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 
978 aa  94.7  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25 
 
 
953 aa  92.4  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 
978 aa  92.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 
822 aa  91.7  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.21 
 
 
923 aa  91.3  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.72 
 
 
978 aa  90.5  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 
974 aa  87.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.45 
 
 
978 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.23 
 
 
974 aa  86.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  23.83 
 
 
981 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 
973 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 
973 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 
858 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.67 
 
 
973 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.67 
 
 
973 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.67 
 
 
973 aa  86.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.67 
 
 
978 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 
974 aa  85.9  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  28.74 
 
 
826 aa  83.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 
961 aa  84  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  23.93 
 
 
879 aa  82.4  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.58 
 
 
979 aa  82  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.98 
 
 
1061 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  23.76 
 
 
968 aa  80.5  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 
1058 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  24.68 
 
 
958 aa  80.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26.29 
 
 
805 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 
805 aa  80.5  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 
879 aa  80.1  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.34 
 
 
781 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.94 
 
 
826 aa  79.3  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  24.41 
 
 
909 aa  78.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.26 
 
 
973 aa  78.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 
916 aa  78.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.99 
 
 
935 aa  78.2  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  34.51 
 
 
759 aa  78.2  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  23.8 
 
 
817 aa  76.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  24.02 
 
 
1065 aa  77  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.66 
 
 
981 aa  77  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.29 
 
 
1155 aa  76.3  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.6 
 
 
1010 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25 
 
 
928 aa  75.9  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.83 
 
 
898 aa  75.9  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
938 aa  75.1  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  23 
 
 
818 aa  75.1  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.28 
 
 
864 aa  74.3  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.23 
 
 
839 aa  72.4  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.69 
 
 
760 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  23.39 
 
 
917 aa  72  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 
932 aa  72  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  28.38 
 
 
760 aa  71.6  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  23.16 
 
 
932 aa  70.9  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  21.69 
 
 
911 aa  70.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  29.13 
 
 
747 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.62 
 
 
760 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
764 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  28.1 
 
 
764 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  25 
 
 
821 aa  70.5  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>