More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0570 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  55.52 
 
 		 974 aa  1077    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  55.11 
 
 		 978 aa  1070    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  54.58 
 
 		 978 aa  1048    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  54.5 
 
 		 969 aa  1050    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  100 
 
 		 958 aa  2004    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  54.58 
 
 		 978 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  54.7 
 
 		 978 aa  1056    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  55.05 
 
 		 978 aa  1060    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  54.57 
 
 		 973 aa  1051    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.85 
 
 		 923 aa  891    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  51.99 
 
 		 932 aa  963    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  53.41 
 
 		 935 aa  1002    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  55.1 
 
 		 974 aa  1065    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  65.93 
 
 		 974 aa  1324    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  52.8 
 
 		 961 aa  1003    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  54.58 
 
 		 973 aa  1047    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  53.91 
 
 		 953 aa  1035    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  52.16 
 
 		 928 aa  933    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  69.57 
 
 		 968 aa  1433    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  54.48 
 
 		 973 aa  1045    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  53.69 
 
 		 979 aa  1042    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  54.58 
 
 		 973 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  63.92 
 
 		 973 aa  1259    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  54.53 
 
 		 981 aa  1049    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  54.58 
 
 		 973 aa  1047    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  55.02 
 
 		 981 aa  1054    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  26.55 
 
 		 858 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  34.6 
 
 		 1426 aa  189  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  33.54 
 
 		 1434 aa  176  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.6 
 
 		 812 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 		 934 aa  174  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 817 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  22.95 
 
 		 927 aa  157  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.82 
 
 		 807 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  23.53 
 
 		 930 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.2 
 
 		 833 aa  153  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  23.09 
 
 		 928 aa  153  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  25.44 
 
 		 932 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  23.29 
 
 		 910 aa  151  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  25.34 
 
 		 803 aa  147  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 		 909 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  21.86 
 
 		 856 aa  146  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  22.49 
 
 		 1029 aa  145  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 		 839 aa  144  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  22.34 
 
 		 992 aa  144  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  23.06 
 
 		 1031 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.67 
 
 		 803 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  28.61 
 
 		 911 aa  143  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  22.99 
 
 		 1022 aa  142  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.18 
 
 		 722 aa  142  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 		 917 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  21.95 
 
 		 855 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 		 913 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 		 938 aa  138  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.71 
 
 		 864 aa  137  7.000000000000001e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  23.82 
 
 		 805 aa  134  6e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 856 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  23.45 
 
 		 805 aa  132  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  22.92 
 
 		 826 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  23.24 
 
 		 1035 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  25.98 
 
 		 1038 aa  129  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  23.14 
 
 		 1035 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 		 784 aa  127  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  29.83 
 
 		 731 aa  126  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  29.66 
 
 		 747 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  24.04 
 
 		 1020 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  22.83 
 
 		 1155 aa  124  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  22.8 
 
 		 1066 aa  123  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  23.71 
 
 		 781 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  29.41 
 
 		 698 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.9 
 
 		 826 aa  121  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  23.76 
 
 		 1020 aa  121  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  23.83 
 
 		 695 aa  120  7.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  33.59 
 
 		 759 aa  120  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  23.76 
 
 		 1020 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 		 891 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  22.47 
 
 		 1035 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 		 758 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  23.76 
 
 		 1020 aa  120  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  21.09 
 
 		 996 aa  119  3e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  22.73 
 
 		 866 aa  119  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.98 
 
 		 745 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  23.49 
 
 		 1020 aa  119  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.32 
 
 		 765 aa  119  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.86 
 
 		 750 aa  118  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1507  molybdopterin oxidoreductase  22.91 
 
 		 915 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.498476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  22.39 
 
 		 1035 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 		 764 aa  118  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  22.17 
 
 		 1087 aa  117  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  21.76 
 
 		 952 aa  118  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 		 698 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 		 1055 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 		 691 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  27.34 
 
 		 757 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  30.38 
 
 		 691 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  29.1 
 
 		 760 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 		 691 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  31.13 
 
 		 691 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  28.8 
 
 		 758 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  28.8 
 
 		 758 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>