More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4208 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 1012 aa  2110    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  38.17 
 
 		 1026 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  80.04 
 
 		 1012 aa  1734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  38.97 
 
 		 1024 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  34.85 
 
 		 1030 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  35.21 
 
 		 1029 aa  579  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  34.27 
 
 		 1064 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  34.27 
 
 		 1064 aa  578  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  33.56 
 
 		 1035 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  34.76 
 
 		 1027 aa  560  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  33.56 
 
 		 1035 aa  561  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  33.37 
 
 		 1035 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  33.56 
 
 		 1035 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  33.53 
 
 		 1036 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  34.15 
 
 		 1020 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  34.11 
 
 		 1066 aa  553  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  33.27 
 
 		 1035 aa  551  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  33.65 
 
 		 1035 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  34.05 
 
 		 1020 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  34.15 
 
 		 1020 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  34.15 
 
 		 1020 aa  552  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  34.15 
 
 		 1020 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  34.94 
 
 		 1038 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  33.37 
 
 		 996 aa  513  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  33.27 
 
 		 1022 aa  511  1e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  32.21 
 
 		 1031 aa  452  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  30.89 
 
 		 1011 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  29.92 
 
 		 992 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  29.39 
 
 		 934 aa  350  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  27.02 
 
 		 1087 aa  275  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.92 
 
 		 1084 aa  274  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.82 
 
 		 1070 aa  271  4e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 1074 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 		 1033 aa  264  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  26.65 
 
 		 1070 aa  254  6e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  23.85 
 
 		 1173 aa  225  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  21.53 
 
 		 961 aa  112  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.51 
 
 		 953 aa  108  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.47 
 
 		 935 aa  104  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  23.78 
 
 		 856 aa  100  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.38 
 
 		 981 aa  99.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  21.76 
 
 		 978 aa  98.6  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  21.21 
 
 		 968 aa  96.3  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.48 
 
 		 974 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  21.64 
 
 		 969 aa  93.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  22.79 
 
 		 979 aa  92.8  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  22.57 
 
 		 981 aa  92  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  21.54 
 
 		 958 aa  91.7  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.35 
 
 		 973 aa  90.5  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  22.35 
 
 		 973 aa  90.5  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 		 817 aa  90.5  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.35 
 
 		 978 aa  90.1  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.35 
 
 		 973 aa  90.1  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  22.35 
 
 		 973 aa  90.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  22.35 
 
 		 973 aa  90.1  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.35 
 
 		 978 aa  89.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  20.8 
 
 		 974 aa  89  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  20.81 
 
 		 974 aa  88.2  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.24 
 
 		 923 aa  88.2  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.88 
 
 		 928 aa  87.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1335  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  21.79 
 
 		 996 aa  86.3  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  23.99 
 
 		 812 aa  85.9  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  21.73 
 
 		 978 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  22.06 
 
 		 978 aa  84.7  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0024  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  23.67 
 
 		 951 aa  79  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  19.91 
 
 		 932 aa  78.2  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.22 
 
 		 973 aa  78.2  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  25.08 
 
 		 955 aa  77.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  22.71 
 
 		 952 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  22.89 
 
 		 916 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  22.89 
 
 		 909 aa  77.4  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  22.57 
 
 		 953 aa  77.4  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  22.42 
 
 		 805 aa  76.6  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  22.55 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0229  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  20.87 
 
 		 838 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  22.3 
 
 		 951 aa  75.1  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 		 759 aa  74.7  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.46 
 
 		 760 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 		 695 aa  73.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  22.03 
 
 		 953 aa  74.3  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 		 744 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  21.76 
 
 		 758 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 		 745 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  23.61 
 
 		 764 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  23.61 
 
 		 764 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  23.61 
 
 		 764 aa  72  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  26.03 
 
 		 750 aa  70.5  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  24.69 
 
 		 754 aa  70.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.14 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 		 764 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 		 879 aa  70.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  24.02 
 
 		 977 aa  70.1  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24.45 
 
 		 760 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  24.44 
 
 		 879 aa  69.7  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  24.16 
 
 		 994 aa  69.7  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  23.15 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.11 
 
 		 836 aa  68.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0233  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  20.72 
 
 		 838 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.900015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 		 1073 aa  68.2  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 		 891 aa  67.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>