More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1020 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  55.58 
 
 		 951 aa  1081    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  54.71 
 
 		 953 aa  1101    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  60.98 
 
 		 1014 aa  1200    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  61.25 
 
 		 994 aa  1217    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  56 
 
 		 955 aa  1075    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  56.21 
 
 		 952 aa  1094    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  36.95 
 
 		 1127 aa  671    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  57.4 
 
 		 967 aa  1078    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  55.57 
 
 		 953 aa  1087    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  43.44 
 
 		 1073 aa  794    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  58.29 
 
 		 953 aa  1110    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  61.83 
 
 		 1016 aa  1212    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 977 aa  2004    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  32.76 
 
 		 879 aa  397  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  32.68 
 
 		 879 aa  396  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1062  molydopterin dinucleotide-binding region  28.42 
 
 		 1318 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.667972  normal  0.812016 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1988  molydopterin dinucleotide-binding region  28.87 
 
 		 1320 aa  213  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.447837 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  25.1 
 
 		 807 aa  173  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  29.45 
 
 		 722 aa  171  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.37 
 
 		 760 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.78 
 
 		 764 aa  152  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.74 
 
 		 764 aa  152  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 		 764 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.52 
 
 		 760 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.94 
 
 		 760 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.65 
 
 		 732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  24.68 
 
 		 760 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  28.88 
 
 		 698 aa  147  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 		 695 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.59 
 
 		 734 aa  144  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  29.19 
 
 		 737 aa  144  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  23.68 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.23 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 		 760 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  29.34 
 
 		 738 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  23.7 
 
 		 758 aa  143  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 		 739 aa  142  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  23.56 
 
 		 758 aa  141  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  23.56 
 
 		 758 aa  141  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 		 731 aa  140  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.32 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 		 731 aa  138  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  22.88 
 
 		 1030 aa  138  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 		 731 aa  138  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.82 
 
 		 731 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 		 684 aa  127  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.2 
 
 		 730 aa  127  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 		 709 aa  127  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 		 978 aa  127  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  28.07 
 
 		 731 aa  127  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.04 
 
 		 781 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  25.56 
 
 		 764 aa  126  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  26.88 
 
 		 700 aa  126  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 		 698 aa  126  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  23.33 
 
 		 932 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 		 677 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 739 aa  125  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  25.7 
 
 		 747 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 		 695 aa  124  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 		 733 aa  124  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.25 
 
 		 726 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 		 726 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  22.2 
 
 		 981 aa  122  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.8 
 
 		 730 aa  122  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  24 
 
 		 974 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.01 
 
 		 744 aa  122  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.87 
 
 		 758 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  31.2 
 
 		 734 aa  121  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  31.8 
 
 		 745 aa  121  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 		 729 aa  121  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.86 
 
 		 942 aa  120  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  26.63 
 
 		 674 aa  120  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 		 791 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  30.61 
 
 		 729 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 		 703 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.56 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.61 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  27.35 
 
 		 704 aa  120  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 726 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.25 
 
 		 726 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  25.64 
 
 		 947 aa  119  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  23.67 
 
 		 974 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  29.71 
 
 		 674 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  27.4 
 
 		 701 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  27.52 
 
 		 673 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  23.56 
 
 		 711 aa  119  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  25.91 
 
 		 695 aa  119  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  22.76 
 
 		 1087 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.34 
 
 		 817 aa  118  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  28.23 
 
 		 710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 817 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  30.36 
 
 		 898 aa  117  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.08 
 
 		 657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 978 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.66 
 
 		 978 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  23.66 
 
 		 973 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  24.43 
 
 		 757 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.66 
 
 		 973 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  24.34 
 
 		 808 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>