More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1793 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  58.35 
 
 
953 aa  1166    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  58.63 
 
 
955 aa  1147    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  58.19 
 
 
952 aa  1167    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  60.98 
 
 
977 aa  1200    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  38.91 
 
 
1127 aa  657    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  58.06 
 
 
967 aa  1141    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  58.03 
 
 
951 aa  1143    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  42 
 
 
1073 aa  767    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  58.24 
 
 
953 aa  1158    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  59.21 
 
 
953 aa  1144    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  100 
 
 
1014 aa  2095    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  89.07 
 
 
1016 aa  1889    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  83.08 
 
 
994 aa  1732    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  33.26 
 
 
879 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  32.39 
 
 
879 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1988  molydopterin dinucleotide-binding region  25.74 
 
 
1320 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.447837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1062  molydopterin dinucleotide-binding region  25.71 
 
 
1318 aa  248  4e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.667972  normal  0.812016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  26.08 
 
 
758 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  26.21 
 
 
758 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  26.08 
 
 
758 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  26.08 
 
 
758 aa  172  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  26.08 
 
 
758 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  24.32 
 
 
807 aa  164  8.000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.25 
 
 
722 aa  160  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.73 
 
 
734 aa  151  5e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.21 
 
 
808 aa  151  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
760 aa  151  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 
760 aa  150  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  23.42 
 
 
808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  23.42 
 
 
808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  26.28 
 
 
731 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.3 
 
 
808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.42 
 
 
808 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.18 
 
 
808 aa  147  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.21 
 
 
808 aa  146  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.06 
 
 
808 aa  145  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.06 
 
 
808 aa  145  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.25 
 
 
732 aa  144  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.68 
 
 
760 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  29.98 
 
 
731 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.34 
 
 
733 aa  139  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.41 
 
 
811 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.09 
 
 
814 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.04 
 
 
814 aa  137  9e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  23.09 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.09 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.09 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  23.09 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.09 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.44 
 
 
730 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.54 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  21.5 
 
 
757 aa  137  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.09 
 
 
814 aa  137  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0362  molybdopterin oxidoreductase  24.73 
 
 
857 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  23.38 
 
 
1087 aa  136  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
698 aa  136  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
764 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1610  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.51 
 
 
812 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462198  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1673  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.51 
 
 
812 aa  135  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  27.35 
 
 
739 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
737 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.31 
 
 
814 aa  134  9e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1840  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.51 
 
 
812 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
738 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1669  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  22.58 
 
 
812 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856631  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1601  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.39 
 
 
812 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.43 
 
 
814 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2315  putative anaerobic dehydrogenase  26.59 
 
 
763 aa  132  3e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  25.1 
 
 
947 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
695 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  22.35 
 
 
726 aa  131  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.03 
 
 
814 aa  131  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.43 
 
 
695 aa  129  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.92 
 
 
760 aa  129  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 
729 aa  129  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 
764 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  24.6 
 
 
932 aa  128  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 
709 aa  128  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 
764 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 
760 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  22.6 
 
 
726 aa  128  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 
731 aa  128  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  26.15 
 
 
760 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
729 aa  127  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.46 
 
 
812 aa  127  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  22.29 
 
 
726 aa  127  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  24.59 
 
 
711 aa  126  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 
758 aa  125  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 
695 aa  125  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  24.85 
 
 
807 aa  125  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  24.85 
 
 
807 aa  125  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.85 
 
 
807 aa  125  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.85 
 
 
807 aa  125  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.85 
 
 
798 aa  125  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  23.9 
 
 
876 aa  125  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 
731 aa  125  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.85 
 
 
807 aa  125  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>