More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2934 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  55.98 
 
 
953 aa  1095    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  55.22 
 
 
955 aa  1067    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  55.82 
 
 
952 aa  1095    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  37.14 
 
 
1127 aa  655    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  57.51 
 
 
967 aa  1073    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  41.97 
 
 
1073 aa  726    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  58.29 
 
 
977 aa  1110    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  59.21 
 
 
1014 aa  1144    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  59.14 
 
 
1016 aa  1153    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  54.98 
 
 
953 aa  1095    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  100 
 
 
953 aa  1962    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  59.04 
 
 
994 aa  1179    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  56.34 
 
 
951 aa  1087    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 
879 aa  385  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  31.2 
 
 
879 aa  386  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1988  molydopterin dinucleotide-binding region  24.54 
 
 
1320 aa  225  3e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.447837 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1062  molydopterin dinucleotide-binding region  24.56 
 
 
1318 aa  222  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.667972  normal  0.812016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.88 
 
 
722 aa  152  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  25.78 
 
 
732 aa  152  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 
695 aa  151  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.55 
 
 
764 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.32 
 
 
764 aa  147  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.42 
 
 
764 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 
731 aa  145  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.37 
 
 
730 aa  144  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.28 
 
 
814 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  24.28 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  22.7 
 
 
808 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.28 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.28 
 
 
814 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  24.28 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.28 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.28 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.28 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  22.46 
 
 
808 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  22.7 
 
 
808 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  24.05 
 
 
726 aa  142  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  22.33 
 
 
808 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  23.81 
 
 
760 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  24.77 
 
 
932 aa  141  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  23.75 
 
 
726 aa  141  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.06 
 
 
814 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  22.61 
 
 
808 aa  140  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  22.33 
 
 
808 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.06 
 
 
814 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  22.33 
 
 
808 aa  139  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.06 
 
 
814 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 
760 aa  140  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 
764 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.06 
 
 
814 aa  139  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  22.21 
 
 
808 aa  138  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  22.21 
 
 
808 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  23.61 
 
 
758 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 
760 aa  137  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  28.33 
 
 
731 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  23.77 
 
 
758 aa  137  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 
739 aa  137  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  23.81 
 
 
761 aa  136  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  23.77 
 
 
758 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.49 
 
 
657 aa  135  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  23.77 
 
 
758 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.22 
 
 
734 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.6 
 
 
703 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
726 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.82 
 
 
814 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.4 
 
 
817 aa  133  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  24.95 
 
 
733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
709 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  23.55 
 
 
764 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  23.99 
 
 
807 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.3 
 
 
760 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  28.82 
 
 
711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  23.64 
 
 
760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3619  molybdopterin oxidoreductase  28.69 
 
 
703 aa  131  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4032  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 
705 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.96 
 
 
978 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.1 
 
 
798 aa  129  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  23.64 
 
 
731 aa  129  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.1 
 
 
798 aa  128  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  25.1 
 
 
807 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.63 
 
 
811 aa  128  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.1 
 
 
807 aa  127  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 
701 aa  127  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  25.1 
 
 
807 aa  127  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.1 
 
 
807 aa  127  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
695 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.1 
 
 
807 aa  127  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.44 
 
 
811 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.44 
 
 
811 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 
978 aa  127  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  28.57 
 
 
969 aa  127  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.96 
 
 
928 aa  127  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 
739 aa  127  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  23.78 
 
 
978 aa  126  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.24 
 
 
811 aa  126  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 
729 aa  126  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
695 aa  125  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  22.61 
 
 
760 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>