More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4062 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  47.27 
 
 		 764 aa  684    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  58.68 
 
 		 756 aa  920    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  100 
 
 		 760 aa  1580    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  93.03 
 
 		 764 aa  1488    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  93.68 
 
 		 764 aa  1499    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  56.73 
 
 		 758 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  56.6 
 
 		 758 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  56.73 
 
 		 758 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  77.04 
 
 		 758 aa  1244    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  42 
 
 		 761 aa  636    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  96.18 
 
 		 764 aa  1531    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  96.05 
 
 		 764 aa  1530    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  79.31 
 
 		 760 aa  1285    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  94.47 
 
 		 760 aa  1508    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  56.46 
 
 		 758 aa  897    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  96.32 
 
 		 764 aa  1534    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  78 
 
 		 760 aa  1274    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  79.45 
 
 		 760 aa  1249    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  56.73 
 
 		 758 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  82.48 
 
 		 760 aa  1320    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  41.15 
 
 		 757 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  39.92 
 
 		 754 aa  596  1e-169  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  34.66 
 
 		 695 aa  416  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  34.03 
 
 		 730 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  34.23 
 
 		 700 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  35.41 
 
 		 722 aa  381  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  33.42 
 
 		 759 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  34.75 
 
 		 695 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 		 698 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  32.41 
 
 		 731 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 		 695 aa  363  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  33.03 
 
 		 731 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  32.15 
 
 		 750 aa  345  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  32.51 
 
 		 738 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  32.67 
 
 		 708 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  30.73 
 
 		 807 aa  340  8e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  32.65 
 
 		 737 aa  337  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  32.24 
 
 		 739 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  32.5 
 
 		 729 aa  331  4e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  30.23 
 
 		 744 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  32.19 
 
 		 704 aa  317  7e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  31.9 
 
 		 739 aa  307  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  32.29 
 
 		 747 aa  301  3e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  29.12 
 
 		 731 aa  301  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 		 731 aa  299  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 		 741 aa  296  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  31.47 
 
 		 720 aa  295  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  31.37 
 
 		 738 aa  294  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.67 
 
 		 731 aa  293  6e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  31.66 
 
 		 739 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 		 747 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.46 
 
 		 733 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.53 
 
 		 734 aa  268  4e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  28.41 
 
 		 685 aa  261  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 		 745 aa  259  9e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 879 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  28.7 
 
 		 698 aa  243  9e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 		 837 aa  241  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.02 
 
 		 732 aa  241  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 936 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.07 
 
 		 739 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 		 879 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.81 
 
 		 792 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.81 
 
 		 792 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 		 729 aa  226  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.28 
 
 		 812 aa  225  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 		 700 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.81 
 
 		 792 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.69 
 
 		 792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.69 
 
 		 792 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  28.42 
 
 		 799 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.93 
 
 		 781 aa  221  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  28.31 
 
 		 749 aa  221  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  28.84 
 
 		 711 aa  221  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.61 
 
 		 692 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.27 
 
 		 793 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.12 
 
 		 833 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 		 891 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.75 
 
 		 731 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.11 
 
 		 685 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 		 856 aa  209  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 		 711 aa  207  8e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  27.05 
 
 		 1143 aa  206  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  27.35 
 
 		 744 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.32 
 
 		 893 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 		 694 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.6 
 
 		 1135 aa  205  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 843 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.29 
 
 		 688 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.05 
 
 		 1139 aa  204  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.4 
 
 		 689 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 		 726 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 		 709 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0242  molydopterin dinucleotide-binding region  27.13 
 
 		 737 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  25.58 
 
 		 791 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.47 
 
 		 900 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0286  twin-arginine translocation pathway signal  25.03 
 
 		 733 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  26.56 
 
 		 899 aa  198  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  27.67 
 
 		 711 aa  196  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.98 
 
 		 814 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>