More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1612 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  59.23 
 
 		 951 aa  1166    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  59.52 
 
 		 955 aa  1193    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  60 
 
 		 952 aa  1195    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  57.4 
 
 		 977 aa  1078    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  60.12 
 
 		 953 aa  1204    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  42.23 
 
 		 1073 aa  748    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 967 aa  1976    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  58.48 
 
 		 953 aa  1183    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  57.51 
 
 		 953 aa  1073    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  58.5 
 
 		 1016 aa  1141    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  59.62 
 
 		 994 aa  1154    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  58.06 
 
 		 1014 aa  1141    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  35.26 
 
 		 1127 aa  595  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  31.8 
 
 		 879 aa  392  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  31.76 
 
 		 879 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1062  molydopterin dinucleotide-binding region  27.05 
 
 		 1318 aa  202  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.667972  normal  0.812016 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1988  molydopterin dinucleotide-binding region  26.9 
 
 		 1320 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.447837 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 		 761 aa  181  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  25 
 
 		 749 aa  177  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  29.54 
 
 		 722 aa  177  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.3 
 
 		 730 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  25.28 
 
 		 758 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  25.28 
 
 		 758 aa  175  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  25.15 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  25.15 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  25.15 
 
 		 758 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 738 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  30.53 
 
 		 739 aa  171  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 		 731 aa  169  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  28.19 
 
 		 731 aa  169  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 695 aa  164  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.34 
 
 		 744 aa  161  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.8 
 
 		 808 aa  157  9e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.81 
 
 		 698 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  23.79 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.67 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  23.79 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.79 
 
 		 808 aa  154  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 		 726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.79 
 
 		 808 aa  154  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.89 
 
 		 808 aa  154  7e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.79 
 
 		 808 aa  154  8e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.54 
 
 		 808 aa  154  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  23.98 
 
 		 764 aa  153  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  23.98 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  23.95 
 
 		 764 aa  153  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.9 
 
 		 731 aa  152  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  24.27 
 
 		 760 aa  152  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  25.3 
 
 		 816 aa  151  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 		 726 aa  151  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.3 
 
 		 816 aa  151  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 791 aa  151  5e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.3 
 
 		 816 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.47 
 
 		 766 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 729 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.63 
 
 		 864 aa  149  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  26.61 
 
 		 732 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.57 
 
 		 679 aa  148  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  23.98 
 
 		 760 aa  148  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  28.02 
 
 		 674 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  24.26 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.26 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.26 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.26 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  24.26 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.26 
 
 		 814 aa  145  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.38 
 
 		 814 aa  145  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.91 
 
 		 739 aa  145  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.26 
 
 		 814 aa  145  5e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.96 
 
 		 734 aa  144  7e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  28.32 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  24.16 
 
 		 833 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 826 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  26.06 
 
 		 807 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  24.02 
 
 		 1087 aa  142  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.85 
 
 		 708 aa  142  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  26.08 
 
 		 747 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.52 
 
 		 814 aa  141  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.59 
 
 		 814 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  27.38 
 
 		 713 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  27.67 
 
 		 733 aa  139  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.31 
 
 		 729 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.19 
 
 		 760 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 		 812 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.83 
 
 		 732 aa  139  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.36 
 
 		 750 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  23.76 
 
 		 981 aa  138  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 		 695 aa  138  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  26.81 
 
 		 711 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 		 759 aa  137  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  24.74 
 
 		 969 aa  137  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 		 745 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  29.61 
 
 		 731 aa  137  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  25.37 
 
 		 711 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  23.95 
 
 		 758 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 747 aa  135  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  28.77 
 
 		 726 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>