More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2777 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  73.77 
 
 		 730 aa  1120    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  100 
 
 		 731 aa  1481    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0125  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.7 
 
 		 966 aa  327  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0106  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.07 
 
 		 966 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00863778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  31.57 
 
 		 711 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2551  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  30.87 
 
 		 920 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.9 
 
 		 804 aa  266  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2269  molybdopterin oxidoreductase  28.97 
 
 		 691 aa  243  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.737839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5665  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  28.37 
 
 		 1037 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.858878  normal  0.730626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0289  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  26.85 
 
 		 1026 aa  226  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120275  hitchhiker  0.0040392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2212  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  27.56 
 
 		 1023 aa  219  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2689  molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0572937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  27.85 
 
 		 833 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3391  molybdopterin oxidoreductase  28.53 
 
 		 686 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 837 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3476  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  26.52 
 
 		 1031 aa  203  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460173  normal  0.230979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2933  molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit, putative  26.76 
 
 		 689 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 		 695 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 		 879 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0222  Fe-S-cluster-containing hydrogenase  28.78 
 
 		 1039 aa  197  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  24.97 
 
 		 879 aa  196  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3386  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  27.36 
 
 		 1029 aa  193  9e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.364426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1527  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  27.43 
 
 		 1036 aa  191  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0528  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  26.03 
 
 		 1028 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 		 826 aa  188  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  23.56 
 
 		 854 aa  187  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  23.56 
 
 		 854 aa  187  8e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 		 843 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.59 
 
 		 722 aa  184  7e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.09 
 
 		 750 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.05 
 
 		 731 aa  178  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 689 aa  177  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 760 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 		 747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.83 
 
 		 760 aa  174  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1425  iron-sulfur binding oxidoreductase  25.97 
 
 		 962 aa  174  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 		 760 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1463  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  25.55 
 
 		 1010 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.210969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01310  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  26.96 
 
 		 1037 aa  173  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462461  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 		 739 aa  173  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1238  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  24.04 
 
 		 993 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.23327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.51 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.37 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.37 
 
 		 764 aa  172  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.37 
 
 		 764 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4140  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  24.86 
 
 		 1010 aa  170  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.14 
 
 		 766 aa  170  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2413  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  27.62 
 
 		 1087 aa  170  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220952  normal  0.47173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 		 759 aa  170  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 856 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.47 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.47 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.47 
 
 		 758 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  26.38 
 
 		 711 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.2 
 
 		 758 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.07 
 
 		 758 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  25.37 
 
 		 764 aa  167  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3983  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.36 
 
 		 1099 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53116  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  23.78 
 
 		 732 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28 
 
 		 688 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5955  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  27.09 
 
 		 942 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  24.93 
 
 		 760 aa  163  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 1007 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.54 
 
 		 730 aa  161  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 758 aa  160  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  25.3 
 
 		 741 aa  160  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  23.9 
 
 		 764 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  23.5 
 
 		 760 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.47 
 
 		 1019 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.985157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 		 678 aa  158  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2713  putative oxidoreductase, iron-sulfur binding protein  26.87 
 
 		 974 aa  157  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0503336  normal  0.426471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 731 aa  157  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2470  molybdopterin oxidoreductase  24.62 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  27.17 
 
 		 711 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  27.11 
 
 		 703 aa  154  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  25.54 
 
 		 747 aa  153  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 		 688 aa  153  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 		 688 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 		 855 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 		 739 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  23 
 
 		 776 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0271  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 		 688 aa  150  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0737341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4428  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.82 
 
 		 950 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  25.63 
 
 		 727 aa  150  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.8 
 
 		 733 aa  150  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  23.8 
 
 		 720 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 		 777 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  23.48 
 
 		 669 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 		 726 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 		 718 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 		 718 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 		 718 aa  147  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 		 744 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  24.79 
 
 		 744 aa  146  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 		 726 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 		 709 aa  146  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 		 726 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 		 662 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 		 936 aa  145  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 737 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>