More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0816 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  56.78 
 
 
739 aa  765    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  48.96 
 
 
773 aa  657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  53.76 
 
 
747 aa  721    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  63.18 
 
 
739 aa  877    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
732 aa  1470    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  84.6 
 
 
721 aa  1186    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  56.64 
 
 
739 aa  784    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  47.3 
 
 
738 aa  619  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  45.73 
 
 
764 aa  619  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  44.97 
 
 
691 aa  617  1e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  48.2 
 
 
768 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  46.86 
 
 
702 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  44.67 
 
 
702 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  43.34 
 
 
704 aa  589  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  44.52 
 
 
702 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  44.52 
 
 
701 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  44.46 
 
 
702 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  44.66 
 
 
702 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  45.07 
 
 
702 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  43.99 
 
 
732 aa  582  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  44.93 
 
 
702 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  41.49 
 
 
1299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  42.03 
 
 
717 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  44.55 
 
 
702 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  46.97 
 
 
731 aa  559  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  40.3 
 
 
729 aa  558  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  39.51 
 
 
741 aa  557  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  44.07 
 
 
753 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  43.76 
 
 
757 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  40 
 
 
713 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  38.34 
 
 
726 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.44 
 
 
733 aa  521  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  41.7 
 
 
687 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 
725 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  36.62 
 
 
733 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  36.25 
 
 
743 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  36.49 
 
 
715 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  34 
 
 
726 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  33.47 
 
 
727 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.56 
 
 
720 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  32.97 
 
 
721 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  33.11 
 
 
721 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  32.97 
 
 
721 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  32.39 
 
 
720 aa  292  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 
671 aa  281  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  29.32 
 
 
679 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  27.08 
 
 
746 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  31.98 
 
 
738 aa  187  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.65 
 
 
804 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.65 
 
 
804 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.65 
 
 
777 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  31.65 
 
 
804 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  31.65 
 
 
777 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.65 
 
 
773 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.65 
 
 
849 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  27.56 
 
 
749 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.33 
 
 
688 aa  177  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.39 
 
 
679 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.64 
 
 
900 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  28.71 
 
 
835 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 
698 aa  174  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.08 
 
 
769 aa  173  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  27.42 
 
 
752 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  27.42 
 
 
752 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.61 
 
 
668 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 
769 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  27.48 
 
 
731 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.79 
 
 
724 aa  167  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 
747 aa  167  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.02 
 
 
951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.02 
 
 
951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
734 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.02 
 
 
951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.02 
 
 
951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  26.72 
 
 
951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  26.72 
 
 
951 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.41 
 
 
893 aa  165  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  28.13 
 
 
899 aa  164  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.72 
 
 
951 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 
715 aa  164  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.28 
 
 
691 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  32.34 
 
 
750 aa  163  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.93 
 
 
691 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.37 
 
 
726 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.9 
 
 
757 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  31.99 
 
 
729 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  25.97 
 
 
693 aa  162  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.72 
 
 
951 aa  161  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 
936 aa  161  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.46 
 
 
689 aa  160  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  29.05 
 
 
753 aa  160  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.56 
 
 
685 aa  160  8e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.19 
 
 
766 aa  160  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  28.86 
 
 
667 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  28.35 
 
 
734 aa  160  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  28.9 
 
 
754 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
756 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.44 
 
 
686 aa  159  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  28.7 
 
 
738 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>