More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1860 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  70.84 
 
 		 727 aa  1106    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  87.6 
 
 		 734 aa  1382    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 734 aa  1543    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  37.76 
 
 		 744 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.89 
 
 		 905 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  39.13 
 
 		 901 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.72 
 
 		 906 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.4 
 
 		 904 aa  499  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  38.6 
 
 		 908 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.04 
 
 		 727 aa  487  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  36.8 
 
 		 716 aa  487  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  37.94 
 
 		 931 aa  485  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  37.61 
 
 		 1176 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  36.6 
 
 		 746 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.46 
 
 		 746 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.11 
 
 		 951 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  39.04 
 
 		 1173 aa  481  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  37.03 
 
 		 908 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.43 
 
 		 724 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  37.59 
 
 		 906 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.81 
 
 		 1003 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  37.87 
 
 		 1188 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.71 
 
 		 951 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.71 
 
 		 951 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.84 
 
 		 951 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.1 
 
 		 734 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.84 
 
 		 951 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.84 
 
 		 951 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.71 
 
 		 951 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.83 
 
 		 907 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.42 
 
 		 894 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  35.59 
 
 		 743 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  36.91 
 
 		 946 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  36.64 
 
 		 958 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.71 
 
 		 951 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  37.36 
 
 		 1171 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  37.19 
 
 		 955 aa  464  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  36.82 
 
 		 953 aa  462  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.81 
 
 		 1395 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  36.1 
 
 		 952 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  35.58 
 
 		 1312 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.37 
 
 		 986 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  35.38 
 
 		 757 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.18 
 
 		 743 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  37.16 
 
 		 762 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.02 
 
 		 952 aa  458  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.62 
 
 		 729 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  34.95 
 
 		 1395 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 		 1397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  34.67 
 
 		 1397 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  36.22 
 
 		 752 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 		 1405 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  35.16 
 
 		 1317 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.2 
 
 		 929 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.25 
 
 		 1338 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 		 1395 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  37.77 
 
 		 933 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 		 1395 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  37.36 
 
 		 933 aa  452  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  35.81 
 
 		 752 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  35.71 
 
 		 954 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  35.61 
 
 		 1409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  34.7 
 
 		 964 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  35.81 
 
 		 752 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  36.64 
 
 		 1257 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  35.77 
 
 		 1180 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  34.98 
 
 		 1342 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  36.25 
 
 		 1396 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.19 
 
 		 1383 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  34.79 
 
 		 779 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 1313 aa  439  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  35.25 
 
 		 1357 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  35.63 
 
 		 1403 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  33.88 
 
 		 1405 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.3 
 
 		 879 aa  438  1e-121  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  35.56 
 
 		 1400 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 		 1384 aa  439  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  35.53 
 
 		 1341 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  34.42 
 
 		 788 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  33.66 
 
 		 1232 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  35.37 
 
 		 899 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  37.01 
 
 		 1370 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  35.38 
 
 		 896 aa  431  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  35.05 
 
 		 1407 aa  430  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.26 
 
 		 906 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  34.49 
 
 		 1228 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  35.71 
 
 		 942 aa  427  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.05 
 
 		 1401 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.29 
 
 		 895 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.78 
 
 		 1271 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  35.92 
 
 		 759 aa  425  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  35.18 
 
 		 1427 aa  423  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35 
 
 		 1418 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  35.14 
 
 		 1418 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.1 
 
 		 766 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  34.44 
 
 		 834 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35 
 
 		 1418 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  34.56 
 
 		 915 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  35 
 
 		 1418 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>