More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5401 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  43.74 
 
 
908 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  44.31 
 
 
906 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.53 
 
 
907 aa  636    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.61 
 
 
904 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  43.83 
 
 
958 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  45.45 
 
 
901 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.73 
 
 
952 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
1228 aa  2547    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  55.04 
 
 
1176 aa  1377    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.45 
 
 
905 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  45.32 
 
 
906 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  44.93 
 
 
908 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  59.9 
 
 
1188 aa  1494    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  75.25 
 
 
1180 aa  1932    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  50.33 
 
 
1173 aa  1223    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  55.22 
 
 
1171 aa  1358    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  43.68 
 
 
954 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.45 
 
 
951 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.45 
 
 
951 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  43.42 
 
 
951 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  43.55 
 
 
951 aa  635  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.58 
 
 
951 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.76 
 
 
929 aa  635  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.58 
 
 
951 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  43.67 
 
 
952 aa  635  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  42.99 
 
 
724 aa  633  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.29 
 
 
951 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.41 
 
 
986 aa  630  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  43.13 
 
 
953 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  44.25 
 
 
931 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.89 
 
 
951 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  43.65 
 
 
915 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  43.65 
 
 
915 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  42.61 
 
 
946 aa  625  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44.49 
 
 
894 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  44.02 
 
 
879 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.61 
 
 
727 aa  616  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  42.84 
 
 
746 aa  616  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  42.97 
 
 
746 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  44.4 
 
 
933 aa  611  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  42.17 
 
 
913 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  41.01 
 
 
894 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.12 
 
 
729 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  42.48 
 
 
955 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  41.65 
 
 
757 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  43.29 
 
 
1003 aa  602  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.33 
 
 
734 aa  594  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  42.65 
 
 
885 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  42.43 
 
 
933 aa  596  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  43.71 
 
 
885 aa  587  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.43 
 
 
942 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  41.72 
 
 
896 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.65 
 
 
915 aa  582  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  42 
 
 
915 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 
883 aa  581  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.06 
 
 
906 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  40.1 
 
 
743 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  40.81 
 
 
907 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  41.99 
 
 
880 aa  579  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  42.82 
 
 
885 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  40.98 
 
 
897 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  40.07 
 
 
885 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  40.88 
 
 
716 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  40.1 
 
 
899 aa  568  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.42 
 
 
873 aa  568  1e-160  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  40.53 
 
 
967 aa  567  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.27 
 
 
904 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  45.34 
 
 
901 aa  564  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  40.19 
 
 
882 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  40.72 
 
 
905 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  40.92 
 
 
896 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.93 
 
 
743 aa  558  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  40.82 
 
 
895 aa  555  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  43.6 
 
 
1396 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  40.84 
 
 
884 aa  555  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  38.7 
 
 
902 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  41.11 
 
 
1409 aa  550  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  40.34 
 
 
870 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  43.28 
 
 
1405 aa  552  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  40.82 
 
 
762 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  40.86 
 
 
919 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.29 
 
 
1395 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  40.94 
 
 
1395 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  39.76 
 
 
942 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  37.9 
 
 
895 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.23 
 
 
874 aa  546  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  39.47 
 
 
894 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  40.37 
 
 
1407 aa  544  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  39.23 
 
 
902 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  40.8 
 
 
1383 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  41.21 
 
 
1395 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  41.67 
 
 
1338 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  41.21 
 
 
1395 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  40.81 
 
 
1397 aa  537  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 
897 aa  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  40.35 
 
 
873 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  40.67 
 
 
1397 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2966  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.4 
 
 
861 aa  535  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  37.89 
 
 
895 aa  533  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  41.64 
 
 
1312 aa  535  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>