More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2680 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  41.91 
 
 
879 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  52.91 
 
 
908 aa  949    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  57.17 
 
 
951 aa  998    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  52.7 
 
 
906 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.45 
 
 
907 aa  951    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  56.89 
 
 
946 aa  1081    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  57.39 
 
 
951 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.08 
 
 
906 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.9 
 
 
894 aa  887    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  57.39 
 
 
951 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.17 
 
 
904 aa  952    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  63.95 
 
 
952 aa  1159    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  52.47 
 
 
901 aa  921    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.75 
 
 
951 aa  998    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  62.91 
 
 
958 aa  1227    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  55.15 
 
 
933 aa  897    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
933 aa  1897    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  43.85 
 
 
1171 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  55.08 
 
 
905 aa  978    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  63.29 
 
 
1003 aa  1240    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  57.17 
 
 
951 aa  998    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  39.18 
 
 
967 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  40.77 
 
 
899 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  57.07 
 
 
951 aa  996    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  64.76 
 
 
954 aa  1232    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  54.09 
 
 
908 aa  946    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  63.84 
 
 
953 aa  1222    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  64.27 
 
 
952 aa  1166    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  54.9 
 
 
906 aa  950    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  70.77 
 
 
929 aa  1318    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  57.07 
 
 
951 aa  996    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  57.28 
 
 
951 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  68.03 
 
 
931 aa  1280    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  65.04 
 
 
986 aa  1218    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  63.95 
 
 
955 aa  1216    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  40.37 
 
 
915 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  40.37 
 
 
915 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 
902 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.5 
 
 
942 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  44.51 
 
 
1176 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  44.21 
 
 
1180 aa  625  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  41.52 
 
 
919 aa  616  1e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.89 
 
 
915 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  40.33 
 
 
913 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  44.79 
 
 
727 aa  614  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  40.7 
 
 
896 aa  615  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  40.59 
 
 
902 aa  615  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  42.43 
 
 
1228 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  43.58 
 
 
1188 aa  611  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  40.69 
 
 
915 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  45.53 
 
 
1173 aa  610  1e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  39.68 
 
 
885 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  41.27 
 
 
885 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  37.03 
 
 
907 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.04 
 
 
873 aa  606  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.1 
 
 
895 aa  608  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  40.6 
 
 
885 aa  608  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  41.4 
 
 
870 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 
894 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  40.34 
 
 
880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  39.45 
 
 
885 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 
894 aa  605  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  44.44 
 
 
734 aa  601  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  39.79 
 
 
883 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  40.4 
 
 
895 aa  596  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  40.13 
 
 
897 aa  595  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  40.53 
 
 
895 aa  592  1e-168  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  37.06 
 
 
905 aa  595  1e-168  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  43.89 
 
 
746 aa  591  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  40.63 
 
 
895 aa  590  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  44.31 
 
 
724 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  41.9 
 
 
910 aa  587  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  43.62 
 
 
746 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  40.62 
 
 
891 aa  587  1e-166  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  40.52 
 
 
901 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  43.34 
 
 
743 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  40.47 
 
 
897 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.64 
 
 
874 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  39.79 
 
 
898 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  43.39 
 
 
716 aa  574  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  44.11 
 
 
882 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  41.32 
 
 
757 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  39.91 
 
 
884 aa  567  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  39.37 
 
 
873 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  43.19 
 
 
729 aa  565  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  36.07 
 
 
942 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.41 
 
 
904 aa  565  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  42.53 
 
 
743 aa  561  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 
896 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.47 
 
 
897 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  40.89 
 
 
892 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2966  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.12 
 
 
861 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.78 
 
 
835 aa  548  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.17 
 
 
1395 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  42.61 
 
 
1395 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  42.61 
 
 
1395 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  42.61 
 
 
1395 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.4 
 
 
1383 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  42.06 
 
 
1397 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  42.06 
 
 
1397 aa  531  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>