More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4449 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  51.34 
 
 		 898 aa  782    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  48.87 
 
 		 902 aa  773    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  60.46 
 
 		 873 aa  1001    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  54 
 
 		 894 aa  837    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  53.97 
 
 		 879 aa  868    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  51.33 
 
 		 913 aa  835    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.51 
 
 		 835 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  43.65 
 
 		 905 aa  738    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  60.89 
 
 		 885 aa  1007    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  51.94 
 
 		 906 aa  844    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  50.46 
 
 		 882 aa  792    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  49.44 
 
 		 907 aa  859    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  49.37 
 
 		 883 aa  793    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1807  molybdopterin oxidoreductase  40.17 
 
 		 971 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  54.98 
 
 		 910 aa  824    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  53.06 
 
 		 897 aa  837    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2966  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  51.74 
 
 		 861 aa  800    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05582  hypothetical protein  40.07 
 
 		 887 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  52.58 
 
 		 895 aa  818    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  64.71 
 
 		 873 aa  1105    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  47.7 
 
 		 915 aa  822    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  51.43 
 
 		 915 aa  851    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  51.43 
 
 		 915 aa  851    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  47.52 
 
 		 899 aa  812    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  52.31 
 
 		 895 aa  821    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  50.73 
 
 		 901 aa  757    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  45.78 
 
 		 896 aa  776    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  46.36 
 
 		 1000 aa  642    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.06 
 
 		 895 aa  765    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  50.79 
 
 		 915 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  60.48 
 
 		 885 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  52 
 
 		 884 aa  799    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  54.4 
 
 		 896 aa  845    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  52.58 
 
 		 895 aa  829    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  44.3 
 
 		 967 aa  754    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.71 
 
 		 942 aa  969    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  52.95 
 
 		 897 aa  822    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  49.38 
 
 		 904 aa  750    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  48.87 
 
 		 902 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  59.89 
 
 		 885 aa  978    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.27 
 
 		 874 aa  825    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  57.51 
 
 		 897 aa  944    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  50.9 
 
 		 892 aa  772    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 870 aa  1741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  47.54 
 
 		 919 aa  776    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  42.53 
 
 		 942 aa  715    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  46.14 
 
 		 894 aa  775    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  60.59 
 
 		 885 aa  986    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  49.49 
 
 		 891 aa  790    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  51.08 
 
 		 880 aa  813    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.79 
 
 		 904 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 		 1094 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  42.42 
 
 		 906 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  41.58 
 
 		 901 aa  614  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  40 
 
 		 906 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  40.06 
 
 		 958 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  40.61 
 
 		 908 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1505  molybdopterin oxidoreductase  38.91 
 
 		 938 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  42.54 
 
 		 1171 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.84 
 
 		 929 aa  602  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  39.32 
 
 		 908 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  42.08 
 
 		 933 aa  595  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  48.87 
 
 		 1173 aa  594  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.59 
 
 		 905 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  41.4 
 
 		 933 aa  592  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  37.84 
 
 		 946 aa  591  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  38.88 
 
 		 830 aa  586  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  44.87 
 
 		 931 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  47.04 
 
 		 804 aa  586  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  39.56 
 
 		 955 aa  572  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.74 
 
 		 1003 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.01 
 
 		 952 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  39.6 
 
 		 953 aa  565  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  44.61 
 
 		 952 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.08 
 
 		 951 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  41.19 
 
 		 951 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.32 
 
 		 951 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  41.19 
 
 		 954 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.98 
 
 		 951 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.47 
 
 		 907 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  40.98 
 
 		 951 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.98 
 
 		 951 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.98 
 
 		 951 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.98 
 
 		 951 aa  558  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  40.74 
 
 		 1176 aa  555  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 		 1188 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  40.34 
 
 		 1228 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  41.91 
 
 		 1180 aa  543  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  41.05 
 
 		 727 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  40.66 
 
 		 746 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  40.66 
 
 		 746 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.27 
 
 		 894 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39 
 
 		 734 aa  502  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.47 
 
 		 729 aa  491  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  39.44 
 
 		 724 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  40.11 
 
 		 1395 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.79 
 
 		 743 aa  476  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  40.41 
 
 		 1395 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  40.22 
 
 		 1395 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  40.11 
 
 		 1397 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>