More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2297 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  49.73 
 
 
873 aa  787    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  72.7 
 
 
895 aa  1313    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  51.51 
 
 
879 aa  837    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  51.82 
 
 
913 aa  836    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  41.82 
 
 
905 aa  709    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  53.48 
 
 
885 aa  887    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
898 aa  1811    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  52.3 
 
 
906 aa  840    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  48.89 
 
 
880 aa  811    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  46.9 
 
 
902 aa  791    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  47.25 
 
 
907 aa  840    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  51.28 
 
 
901 aa  772    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  59.3 
 
 
897 aa  1031    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  47.12 
 
 
902 aa  794    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  51.7 
 
 
915 aa  864    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  61.25 
 
 
897 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2966  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  49.44 
 
 
861 aa  767    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  51.8 
 
 
885 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  51.52 
 
 
885 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 
1000 aa  673    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1807  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 
971 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.61 
 
 
873 aa  822    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  46.59 
 
 
915 aa  789    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  70.12 
 
 
910 aa  1216    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  46.61 
 
 
896 aa  811    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  49.55 
 
 
895 aa  786    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  52.12 
 
 
915 aa  819    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44.22 
 
 
835 aa  701    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  47.7 
 
 
899 aa  833    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  50.33 
 
 
884 aa  778    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  51.97 
 
 
885 aa  841    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  42.95 
 
 
967 aa  741    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  49.63 
 
 
942 aa  864    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  48.02 
 
 
919 aa  784    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  47.96 
 
 
883 aa  798    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  52.25 
 
 
874 aa  810    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.49 
 
 
904 aa  793    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  51.44 
 
 
896 aa  816    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1505  molybdopterin oxidoreductase  40.56 
 
 
938 aa  647    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  48.93 
 
 
882 aa  786    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  59.27 
 
 
892 aa  996    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  43.09 
 
 
942 aa  719    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  52.64 
 
 
897 aa  874    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  51.56 
 
 
870 aa  795    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  51.7 
 
 
915 aa  864    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  72.81 
 
 
895 aa  1310    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  73.7 
 
 
895 aa  1327    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  43.37 
 
 
894 aa  777    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  70.01 
 
 
894 aa  1229    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  49.84 
 
 
891 aa  817    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  48.55 
 
 
804 aa  620  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05582  hypothetical protein  43.37 
 
 
887 aa  619  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.81 
 
 
929 aa  610  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  41.47 
 
 
906 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  44.92 
 
 
1094 aa  608  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.3 
 
 
907 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  40.8 
 
 
908 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  39.94 
 
 
958 aa  598  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.98 
 
 
904 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  40.65 
 
 
954 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  40.42 
 
 
953 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  44.83 
 
 
931 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  37.22 
 
 
946 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.8 
 
 
905 aa  588  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  38.5 
 
 
906 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  38.83 
 
 
908 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  39.91 
 
 
901 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  38.47 
 
 
830 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  39.89 
 
 
933 aa  579  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.85 
 
 
952 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  45.5 
 
 
952 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  42.87 
 
 
933 aa  568  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.74 
 
 
951 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.34 
 
 
1003 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  39.05 
 
 
955 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  39.92 
 
 
1171 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  45.2 
 
 
951 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.33 
 
 
951 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  45.06 
 
 
951 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.06 
 
 
951 aa  552  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.06 
 
 
951 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.06 
 
 
951 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.06 
 
 
951 aa  552  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  40.84 
 
 
1188 aa  551  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.39 
 
 
986 aa  550  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.8 
 
 
894 aa  547  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  40.33 
 
 
1180 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  39.05 
 
 
1228 aa  539  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  42.97 
 
 
1173 aa  538  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  40.49 
 
 
746 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  40.49 
 
 
746 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  39.53 
 
 
1176 aa  535  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.95 
 
 
727 aa  528  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  41.96 
 
 
743 aa  520  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  40.45 
 
 
724 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.96 
 
 
729 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  41.27 
 
 
743 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.19 
 
 
734 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  41.22 
 
 
716 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  42.86 
 
 
1418 aa  498  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>