More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2310 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  55.51 
 
 		 931 aa  961    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  42.93 
 
 		 913 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  53.68 
 
 		 908 aa  976    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.15 
 
 		 951 aa  925    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  53.59 
 
 		 906 aa  975    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.25 
 
 		 907 aa  988    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.04 
 
 		 951 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  58.88 
 
 		 901 aa  1042    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  100 
 
 		 894 aa  1783    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.36 
 
 		 951 aa  927    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  47.16 
 
 		 1180 aa  666    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.57 
 
 		 904 aa  1016    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  50.63 
 
 		 1173 aa  656    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  54.88 
 
 		 954 aa  941    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  44.49 
 
 		 1228 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.24 
 
 		 951 aa  952    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  58.28 
 
 		 905 aa  1047    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  42.59 
 
 		 915 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  55.16 
 
 		 958 aa  998    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  42.59 
 
 		 915 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  55.06 
 
 		 933 aa  949    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  55.25 
 
 		 951 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.46 
 
 		 1003 aa  949    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  59.12 
 
 		 933 aa  944    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  45.63 
 
 		 1171 aa  679    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  45.27 
 
 		 1176 aa  650    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  50.8 
 
 		 946 aa  937    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  54.45 
 
 		 952 aa  944    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.04 
 
 		 951 aa  923    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  56.26 
 
 		 908 aa  1007    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  56.37 
 
 		 906 aa  1004    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  55.25 
 
 		 951 aa  925    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.77 
 
 		 929 aa  974    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  46.54 
 
 		 1188 aa  657    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.01 
 
 		 986 aa  956    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  53.72 
 
 		 955 aa  957    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.66 
 
 		 952 aa  950    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.15 
 
 		 951 aa  925    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  53.13 
 
 		 953 aa  928    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  42.92 
 
 		 879 aa  632  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  42.79 
 
 		 896 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.36 
 
 		 906 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  38.26 
 
 		 907 aa  620  1e-176  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  40.84 
 
 		 897 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  38.06 
 
 		 896 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  37.21 
 
 		 905 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  39.36 
 
 		 899 aa  605  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.73 
 
 		 915 aa  598  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.23 
 
 		 895 aa  598  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  40.41 
 
 		 915 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  43.44 
 
 		 901 aa  598  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.27 
 
 		 873 aa  593  1e-168  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  39.93 
 
 		 885 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  40.4 
 
 		 885 aa  595  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  39.89 
 
 		 902 aa  591  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  39.35 
 
 		 902 aa  592  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 		 1395 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  37.58 
 
 		 967 aa  591  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.32 
 
 		 942 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  45.48 
 
 		 1397 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  45.76 
 
 		 1397 aa  591  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  45.62 
 
 		 1395 aa  588  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  45.4 
 
 		 1405 aa  586  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  39.43 
 
 		 880 aa  586  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 		 1395 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  44.55 
 
 		 724 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  46.04 
 
 		 1395 aa  588  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  40.9 
 
 		 885 aa  587  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  45.71 
 
 		 1396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  40.58 
 
 		 885 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  41.09 
 
 		 873 aa  581  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.08 
 
 		 874 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  38.91 
 
 		 883 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  37.25 
 
 		 894 aa  581  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  39.63 
 
 		 919 aa  581  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  43.78 
 
 		 716 aa  573  1.0000000000000001e-162  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.6 
 
 		 727 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  40.72 
 
 		 897 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  41.37 
 
 		 884 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  43.62 
 
 		 734 aa  575  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  40.92 
 
 		 894 aa  571  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 746 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  40.54 
 
 		 895 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  36.63 
 
 		 942 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  39.48 
 
 		 891 aa  570  1e-161  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  40.69 
 
 		 898 aa  566  1e-160  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 746 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  43.3 
 
 		 729 aa  568  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  43.47 
 
 		 1407 aa  566  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  45.02 
 
 		 1400 aa  569  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  40.5 
 
 		 895 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  42.54 
 
 		 1383 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.22 
 
 		 904 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  39.19 
 
 		 882 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  40.35 
 
 		 870 aa  565  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  40.93 
 
 		 757 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  40.61 
 
 		 895 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  40.44 
 
 		 1409 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  41.38 
 
 		 910 aa  555  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  45.3 
 
 		 1405 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>