More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2865 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  61.07 
 
 
897 aa  1052    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
894 aa  1793    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  52.54 
 
 
879 aa  833    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  46.86 
 
 
919 aa  762    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  51.7 
 
 
913 aa  834    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  70.04 
 
 
895 aa  1237    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  42.97 
 
 
905 aa  718    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  51.31 
 
 
874 aa  816    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  52.58 
 
 
897 aa  852    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.79 
 
 
906 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  88.1 
 
 
910 aa  1545    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  49.43 
 
 
880 aa  831    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  47.6 
 
 
907 aa  857    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  48.09 
 
 
902 aa  832    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  69.74 
 
 
898 aa  1190    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  60.11 
 
 
897 aa  1038    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2966  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.51 
 
 
861 aa  785    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  48.59 
 
 
899 aa  865    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  61.29 
 
 
892 aa  1021    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  50.84 
 
 
901 aa  766    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  51.94 
 
 
873 aa  846    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  46.84 
 
 
915 aa  823    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  42.11 
 
 
942 aa  705    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  53.75 
 
 
885 aa  874    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  46.38 
 
 
896 aa  817    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  49.55 
 
 
882 aa  819    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  49.94 
 
 
895 aa  794    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  52.69 
 
 
915 aa  831    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  50.68 
 
 
884 aa  800    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  53.3 
 
 
896 aa  847    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  71.04 
 
 
895 aa  1259    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  44.27 
 
 
967 aa  759    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.37 
 
 
942 aa  879    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.4 
 
 
835 aa  707    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  53.56 
 
 
885 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  70.04 
 
 
895 aa  1243    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  48.48 
 
 
904 aa  771    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  53.79 
 
 
885 aa  878    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  48.48 
 
 
902 aa  838    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  50.11 
 
 
883 aa  828    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  51.47 
 
 
873 aa  805    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1807  molybdopterin oxidoreductase  39.98 
 
 
971 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315669  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  54 
 
 
870 aa  837    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  50.75 
 
 
804 aa  664    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  54.52 
 
 
885 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  51.21 
 
 
915 aa  855    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  45.36 
 
 
894 aa  789    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  51.43 
 
 
891 aa  829    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  51.21 
 
 
915 aa  855    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  44.4 
 
 
1000 aa  635  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05582  hypothetical protein  39.53 
 
 
887 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  47.72 
 
 
931 aa  620  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1505  molybdopterin oxidoreductase  38.23 
 
 
938 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  41.01 
 
 
908 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  41.8 
 
 
906 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.41 
 
 
929 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.79 
 
 
907 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  43.08 
 
 
933 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.24 
 
 
906 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.57 
 
 
905 aa  602  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  43.4 
 
 
1094 aa  601  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  40.86 
 
 
901 aa  598  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.11 
 
 
904 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.74 
 
 
1003 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  37.87 
 
 
946 aa  595  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  39.54 
 
 
908 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  41.42 
 
 
933 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  44.34 
 
 
958 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  46.46 
 
 
954 aa  583  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  45.61 
 
 
1173 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  39.66 
 
 
955 aa  585  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  41.03 
 
 
951 aa  582  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.72 
 
 
951 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  38.99 
 
 
830 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  40.62 
 
 
951 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  40.62 
 
 
951 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.51 
 
 
951 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.51 
 
 
951 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.51 
 
 
951 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  40.51 
 
 
951 aa  570  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  44.73 
 
 
953 aa  571  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  41.49 
 
 
1180 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44.49 
 
 
986 aa  567  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  40.96 
 
 
1171 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  39.81 
 
 
1176 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  40.34 
 
 
1188 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  39.47 
 
 
1228 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  44.48 
 
 
894 aa  531  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  41.87 
 
 
716 aa  528  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  41.9 
 
 
729 aa  527  1e-148  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.36 
 
 
727 aa  521  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  41.08 
 
 
746 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  40.66 
 
 
746 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.53 
 
 
734 aa  514  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  40.64 
 
 
724 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  41.08 
 
 
743 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  37.48 
 
 
757 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  41.02 
 
 
743 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  39.97 
 
 
1397 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  39.84 
 
 
1397 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>