More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1505 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  40.42 
 
 		 915 aa  666    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  45.81 
 
 		 879 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  40.34 
 
 		 913 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1807  molybdopterin oxidoreductase  48.52 
 
 		 971 aa  880    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.315669  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.14 
 
 		 906 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  41.11 
 
 		 885 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  46.68 
 
 		 907 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05582  hypothetical protein  40.74 
 
 		 887 aa  660    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  41.8 
 
 		 897 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.14 
 
 		 915 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2297  molybdopterin oxidoreductase  46.1 
 
 		 898 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.354488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  47.07 
 
 		 896 aa  666    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  46.71 
 
 		 967 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1505  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 938 aa  1939    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  40.42 
 
 		 915 aa  666    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  40.69 
 
 		 894 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.24 
 
 		 897 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  46.03 
 
 		 885 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  39.59 
 
 		 899 aa  629  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  43.71 
 
 		 885 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  39.76 
 
 		 897 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.47 
 
 		 873 aa  622  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  44.24 
 
 		 915 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  38.23 
 
 		 894 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0670  molybdopterin oxidoreductase  38.93 
 
 		 896 aa  622  1e-176  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.611773  normal  0.0334973 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1450  molybdopterin oxidoreductase  46.54 
 
 		 885 aa  622  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16865  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001602  assimilatory nitrate reductase large subunit  41.05 
 
 		 830 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2905  molybdopterin oxidoreductase  39.4 
 
 		 883 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1119  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.65 
 
 		 895 aa  616  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.45 
 
 		 942 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  38.48 
 
 		 910 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1545  molybdopterin oxidoreductase  45.14 
 
 		 902 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  40.67 
 
 		 905 aa  612  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  40.55 
 
 		 880 aa  611  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  42.73 
 
 		 895 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  44.65 
 
 		 902 aa  610  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  38.09 
 
 		 895 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1442  molybdopterin oxidoreductase  40.26 
 
 		 882 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.056801  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  38.91 
 
 		 870 aa  603  1.0000000000000001e-171  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  38.8 
 
 		 892 aa  599  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  44.54 
 
 		 884 aa  600  1e-170  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  38.09 
 
 		 895 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0178  molybdopterin oxidoreductase  43.82 
 
 		 891 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1112  molybdopterin oxidoreductase  44.78 
 
 		 919 aa  594  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03658  nitrate reductase  43.67 
 
 		 942 aa  594  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.47 
 
 		 874 aa  592  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  39.02 
 
 		 901 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1548  molybdopterin oxidoreductase  42.41 
 
 		 1000 aa  582  1e-164  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118876  normal  0.471457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1669  nitrate reductase  39.43 
 
 		 873 aa  582  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.761337  normal  0.453299 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1702  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.66 
 
 		 904 aa  578  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0601205  normal  0.585454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.08 
 
 		 835 aa  571  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2966  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.32 
 
 		 861 aa  555  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  36.27 
 
 		 906 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1323  molybdopterin oxidoreductase  41.07 
 
 		 1094 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  36.27 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  36.02 
 
 		 901 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  40.22 
 
 		 1171 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.64 
 
 		 904 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  37.82 
 
 		 1173 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  35.68 
 
 		 908 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.48 
 
 		 905 aa  524  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  36.13 
 
 		 906 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3284  molybdopterin oxidoreductase  39.21 
 
 		 804 aa  521  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.9 
 
 		 929 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  34.15 
 
 		 946 aa  504  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  39.43 
 
 		 1188 aa  503  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  39.2 
 
 		 931 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  36.9 
 
 		 1228 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  40.46 
 
 		 933 aa  498  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  39.92 
 
 		 952 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  38.91 
 
 		 1180 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.79 
 
 		 952 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.78 
 
 		 907 aa  493  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  33.5 
 
 		 958 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.62 
 
 		 894 aa  486  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  34.98 
 
 		 933 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.35 
 
 		 986 aa  485  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  38.88 
 
 		 954 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  37.16 
 
 		 1176 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 955 aa  479  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  38.9 
 
 		 953 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.99 
 
 		 1003 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  37.76 
 
 		 951 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.71 
 
 		 951 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.76 
 
 		 951 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.8 
 
 		 951 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  37.76 
 
 		 951 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.76 
 
 		 951 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.76 
 
 		 951 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.71 
 
 		 951 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  36.64 
 
 		 743 aa  452  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.25 
 
 		 743 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  35.61 
 
 		 746 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  35.84 
 
 		 724 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  35.74 
 
 		 746 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.27 
 
 		 727 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  37.65 
 
 		 1405 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.74 
 
 		 729 aa  432  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  36.39 
 
 		 716 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 		 1384 aa  428  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>