More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_09037  periplasmic nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15190)  56.68 
 
 		 1009 aa  900    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  63.71 
 
 		 788 aa  1002    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2122  molybdopterin oxidoreductase  52.02 
 
 		 814 aa  723    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.890229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  100 
 
 		 834 aa  1699    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  64.03 
 
 		 964 aa  1019    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4538  molybdopterin oxidoreductase  60.32 
 
 		 830 aa  973    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104791  normal  0.555476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  69.27 
 
 		 779 aa  1120    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  67.29 
 
 		 818 aa  1060    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  67.48 
 
 		 776 aa  1045    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  40.95 
 
 		 744 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  38.42 
 
 		 762 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.3 
 
 		 727 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  37.08 
 
 		 931 aa  436  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  37.95 
 
 		 752 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  38.08 
 
 		 752 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  35.1 
 
 		 758 aa  429  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  38.16 
 
 		 752 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  34.44 
 
 		 734 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  34 
 
 		 734 aa  421  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.06 
 
 		 724 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  37.8 
 
 		 908 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  36.49 
 
 		 908 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.27 
 
 		 746 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  35.67 
 
 		 906 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.19 
 
 		 904 aa  411  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  34.44 
 
 		 757 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  36.99 
 
 		 906 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  37.14 
 
 		 1173 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  36.13 
 
 		 746 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  35.4 
 
 		 958 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  36.81 
 
 		 901 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.54 
 
 		 905 aa  404  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.19 
 
 		 907 aa  402  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.35 
 
 		 894 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.81 
 
 		 734 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.27 
 
 		 929 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 		 946 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  36.66 
 
 		 954 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.42 
 
 		 1003 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  36.18 
 
 		 952 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 		 955 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.03 
 
 		 727 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.01 
 
 		 952 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  34.33 
 
 		 1176 aa  391  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.68 
 
 		 986 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  34.26 
 
 		 755 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  35.39 
 
 		 953 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  31.57 
 
 		 1171 aa  382  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  37 
 
 		 933 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.2 
 
 		 766 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.74 
 
 		 677 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.86 
 
 		 951 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.9 
 
 		 951 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  35.86 
 
 		 951 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 		 1407 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 		 716 aa  376  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  35.86 
 
 		 951 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.42 
 
 		 879 aa  372  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.59 
 
 		 951 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.72 
 
 		 951 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.59 
 
 		 951 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.72 
 
 		 951 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 658 aa  372  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.09 
 
 		 729 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  34.75 
 
 		 1312 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  34.44 
 
 		 1409 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  34.54 
 
 		 741 aa  369  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.2 
 
 		 893 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  36.34 
 
 		 1396 aa  368  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.67 
 
 		 1383 aa  366  1e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 		 1405 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  36.64 
 
 		 759 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.11 
 
 		 1384 aa  365  2e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  33.6 
 
 		 1180 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.06 
 
 		 904 aa  364  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  32.94 
 
 		 743 aa  362  1e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  32.55 
 
 		 770 aa  362  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  35.17 
 
 		 1397 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  35.03 
 
 		 1397 aa  361  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  32.85 
 
 		 1228 aa  360  5e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.35 
 
 		 688 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.47 
 
 		 1232 aa  359  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.82 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.62 
 
 		 688 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  34.4 
 
 		 1317 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  35.03 
 
 		 1395 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  35.03 
 
 		 1395 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 		 1338 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  35.03 
 
 		 1395 aa  357  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.98 
 
 		 674 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.04 
 
 		 1395 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  31.9 
 
 		 687 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.39 
 
 		 674 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.85 
 
 		 674 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.47 
 
 		 906 aa  354  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 		 1188 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.85 
 
 		 674 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  33.29 
 
 		 745 aa  353  8e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  34.68 
 
 		 708 aa  352  1e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  33.24 
 
 		 695 aa  350  6e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>