More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0961 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  52.67 
 
 
758 aa  793    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  97.34 
 
 
752 aa  1480    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  99.47 
 
 
752 aa  1531    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  46.12 
 
 
770 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
752 aa  1539    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  53.78 
 
 
755 aa  801    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  51.25 
 
 
762 aa  769    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2680  nitrate reductase catalytic subunit  39.64 
 
 
831 aa  580  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.232785  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2981  nitrate reductase catalytic subunit  39.83 
 
 
834 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237893  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2427  nitrate reductase catalytic subunit  39.28 
 
 
829 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0968104  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3486  nitrate reductase catalytic subunit  40.89 
 
 
828 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.125149  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2411  nitrate reductase catalytic subunit  39.74 
 
 
828 aa  566  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1903  nitrate reductase catalytic subunit  40.32 
 
 
829 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2383  nitrate reductase catalytic subunit  39.55 
 
 
831 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0655186  normal  0.338033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3343  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
828 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.139665  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1842  nitrate reductase catalytic subunit  39.29 
 
 
829 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.889762  hitchhiker  0.000540114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2135  nitrate reductase catalytic subunit  39.29 
 
 
829 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1770  nitrate reductase catalytic subunit  38.62 
 
 
831 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1453  periplasmic nitrate reductase, large subunit  39.02 
 
 
828 aa  561  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2344  nitrate reductase catalytic subunit  38.9 
 
 
828 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2715  nitrate reductase catalytic subunit  39.38 
 
 
828 aa  562  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0735  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
828 aa  561  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2791  nitrate reductase catalytic subunit  39.14 
 
 
830 aa  560  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0978398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1444  nitrate reductase catalytic subunit  38.9 
 
 
828 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1910  nitrate reductase catalytic subunit  39.87 
 
 
829 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.930767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1936  nitrate reductase catalytic subunit  39.87 
 
 
829 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1943  nitrate reductase catalytic subunit  39.95 
 
 
829 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.212211  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2354  nitrate reductase catalytic subunit  38.9 
 
 
828 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4205  nitrate reductase catalytic subunit  39.93 
 
 
834 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153264  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1900  nitrate reductase catalytic subunit  38.93 
 
 
829 aa  559  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194918 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1387  nitrate reductase catalytic subunit  39.14 
 
 
830 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1273  nitrate reductase catalytic subunit  39.14 
 
 
830 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2443  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
828 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.556235 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02133  nitrate reductase, periplasmic, large subunit  38.78 
 
 
828 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.976817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2485  nitrate reductase catalytic subunit  39.26 
 
 
828 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2499  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
828 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.444552  hitchhiker  0.00117092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2394  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
828 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2505  nitrate reductase catalytic subunit  38.78 
 
 
828 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02092  hypothetical protein  38.78 
 
 
828 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.961372  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2602  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
828 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.475066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49250  nitrate reductase catalytic subunit  39.69 
 
 
834 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.562968  normal  0.0276876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1622  nitrate reductase catalytic subunit  39.27 
 
 
831 aa  556  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0868309  normal  0.125549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3515  nitrate reductase catalytic subunit  38.19 
 
 
837 aa  554  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0949945  hitchhiker  0.00218526 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0952  nitrate reductase catalytic subunit  39.68 
 
 
837 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1862  nitrate reductase catalytic subunit  39 
 
 
834 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2174  nitrate reductase catalytic subunit  39.23 
 
 
831 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.642457  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2553  nitrate reductase catalytic subunit  38.71 
 
 
829 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.4401  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0084  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 
831 aa  546  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0367  nitrate reductase catalytic subunit  39.5 
 
 
827 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.870731  hitchhiker  0.000366868 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4763  nitrate reductase catalytic subunit  38.08 
 
 
831 aa  544  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3165  nitrate reductase catalytic subunit  39.02 
 
 
831 aa  543  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1913  nitrate reductase catalytic subunit  38.7 
 
 
829 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000463649  normal  0.796386 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4063  nitrate reductase catalytic subunit  38.32 
 
 
831 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127996  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3206  nitrate reductase catalytic subunit  38.27 
 
 
827 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1019  nitrate reductase catalytic subunit  39.38 
 
 
838 aa  542  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4116  nitrate reductase catalytic subunit  39.5 
 
 
831 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.568266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3148  nitrate reductase catalytic subunit  37.47 
 
 
826 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1497  nitrate reductase catalytic subunit  38.64 
 
 
829 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1508  nitrate reductase catalytic subunit  38.12 
 
 
827 aa  538  1e-151  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1591  nitrate reductase catalytic subunit  38.55 
 
 
837 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2983  nitrate reductase catalytic subunit  38.39 
 
 
827 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0848  nitrate reductase catalytic subunit  37.47 
 
 
826 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0824  nitrate reductase catalytic subunit  38.12 
 
 
831 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1343  nitrate reductase catalytic subunit  38.17 
 
 
851 aa  531  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.511379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1057  nitrate reductase catalytic subunit  39.1 
 
 
832 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4009  nitrate reductase catalytic subunit  36.97 
 
 
848 aa  531  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5180  nitrate reductase catalytic subunit  38.85 
 
 
834 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.727522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0859  nitrate reductase catalytic subunit  37.42 
 
 
831 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0704  nitrate reductase catalytic subunit  38.48 
 
 
826 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3318  nitrate reductase catalytic subunit  38.48 
 
 
826 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3430  nitrate reductase catalytic subunit  38.48 
 
 
826 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3222  nitrate reductase catalytic subunit  38.63 
 
 
828 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497822  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0617  nitrate reductase catalytic subunit  38.54 
 
 
829 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3990  nitrate reductase catalytic subunit  38.82 
 
 
831 aa  528  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.774592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4110  nitrate reductase catalytic subunit  38.19 
 
 
826 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000513  periplasmic nitrate reductase precursor  37.25 
 
 
829 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0553  nitrate reductase catalytic subunit  37.55 
 
 
827 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05377  nitrate reductase catalytic subunit  37.6 
 
 
829 aa  521  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2438  nitrate reductase catalytic subunit  37.14 
 
 
839 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.627702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3511  nitrate reductase catalytic subunit  37.88 
 
 
831 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2844  nitrate reductase catalytic subunit  36.95 
 
 
838 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2938  nitrate reductase catalytic subunit  37.92 
 
 
835 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0847  nitrate reductase catalytic subunit  37.3 
 
 
831 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.22751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0623  nitrate reductase catalytic subunit  37.67 
 
 
826 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729608  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3957  nitrate reductase catalytic subunit  37.42 
 
 
826 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.29 
 
 
727 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  41.16 
 
 
744 aa  509  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  41.31 
 
 
1395 aa  500  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 
1397 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  41.98 
 
 
1395 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  41.51 
 
 
1397 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  41.98 
 
 
1395 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  41.18 
 
 
906 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  41.29 
 
 
1395 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  38.42 
 
 
746 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  40.96 
 
 
1405 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  40.88 
 
 
908 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  38.28 
 
 
746 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  41.48 
 
 
1409 aa  489  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  42.52 
 
 
1418 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>