More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2353 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  70.84 
 
 		 734 aa  1106    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  70.16 
 
 		 734 aa  1101    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  100 
 
 		 727 aa  1528    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  37.45 
 
 		 744 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.86 
 
 		 906 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  39.35 
 
 		 908 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  39.52 
 
 		 901 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  38.02 
 
 		 746 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  37.88 
 
 		 746 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  36.99 
 
 		 716 aa  501  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.32 
 
 		 904 aa  497  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  38.25 
 
 		 1173 aa  497  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.22 
 
 		 727 aa  495  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 724 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  38.05 
 
 		 1188 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.98 
 
 		 905 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.43 
 
 		 734 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  38.33 
 
 		 1180 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  37.91 
 
 		 1176 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  37.17 
 
 		 743 aa  482  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.38 
 
 		 743 aa  482  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  37.13 
 
 		 906 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  35.94 
 
 		 757 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  35.57 
 
 		 954 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.99 
 
 		 907 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  37.39 
 
 		 1171 aa  476  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  36.56 
 
 		 908 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  36.57 
 
 		 931 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.43 
 
 		 951 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.43 
 
 		 951 aa  474  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.29 
 
 		 951 aa  473  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.02 
 
 		 951 aa  473  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.43 
 
 		 951 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  36.26 
 
 		 946 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.29 
 
 		 951 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  36.67 
 
 		 1228 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.29 
 
 		 951 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.29 
 
 		 951 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  35.76 
 
 		 952 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.88 
 
 		 729 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.82 
 
 		 1384 aa  467  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.35 
 
 		 952 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.97 
 
 		 986 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  35.97 
 
 		 955 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  37.17 
 
 		 762 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  36.03 
 
 		 1395 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.67 
 
 		 1395 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  37.09 
 
 		 758 aa  458  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.98 
 
 		 929 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 		 953 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  34.68 
 
 		 958 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.17 
 
 		 1003 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  36.49 
 
 		 1312 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.68 
 
 		 894 aa  452  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  36.4 
 
 		 752 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  37.81 
 
 		 933 aa  452  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.64 
 
 		 1383 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 		 1395 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  36.42 
 
 		 779 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 		 1395 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.44 
 
 		 1338 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.89 
 
 		 906 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  35.61 
 
 		 1397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  36.43 
 
 		 1342 aa  449  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  35.75 
 
 		 1397 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  38.09 
 
 		 1370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  36.04 
 
 		 879 aa  446  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  35.85 
 
 		 752 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  35.64 
 
 		 1317 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  35.99 
 
 		 752 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  35.37 
 
 		 885 aa  444  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  36.82 
 
 		 1405 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  35.59 
 
 		 907 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  37.05 
 
 		 741 aa  442  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.09 
 
 		 1232 aa  440  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  36.09 
 
 		 1357 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  36.98 
 
 		 1257 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  36.35 
 
 		 1396 aa  438  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  35.3 
 
 		 834 aa  436  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 		 880 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  35.94 
 
 		 1341 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.38 
 
 		 874 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.98 
 
 		 1271 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  34.76 
 
 		 896 aa  436  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.89 
 
 		 1271 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.89 
 
 		 1271 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  35.23 
 
 		 905 aa  429  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  34.34 
 
 		 1405 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  36.49 
 
 		 759 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  34.27 
 
 		 899 aa  430  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  34.99 
 
 		 915 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  36.17 
 
 		 1409 aa  431  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  35.99 
 
 		 1313 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  35.98 
 
 		 897 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  34.99 
 
 		 915 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  35.67 
 
 		 933 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  35.56 
 
 		 885 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4538  molybdopterin oxidoreductase  34.04 
 
 		 830 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104791  normal  0.555476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 		 1394 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  35.03 
 
 		 770 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>