More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4016 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  97.99 
 
 		 1357 aa  2623    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  56.16 
 
 		 1384 aa  1516    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  60.14 
 
 		 1232 aa  872    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  55.26 
 
 		 1342 aa  1414    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  58.11 
 
 		 1418 aa  1565    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  58.89 
 
 		 1398 aa  1572    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  57.94 
 
 		 1395 aa  1594    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  58.04 
 
 		 1418 aa  1562    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  59.37 
 
 		 1396 aa  1588    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  84.31 
 
 		 1257 aa  1271    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  53.32 
 
 		 1317 aa  1396    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  57.6 
 
 		 1427 aa  1559    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  58.04 
 
 		 1418 aa  1562    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  61.17 
 
 		 1271 aa  914    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  60.64 
 
 		 1383 aa  1667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  58.18 
 
 		 1418 aa  1565    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  57.6 
 
 		 1401 aa  1592    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  58.02 
 
 		 1403 aa  1602    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  53.31 
 
 		 1313 aa  1371    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  57.71 
 
 		 1405 aa  1557    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  53.05 
 
 		 1370 aa  1318    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 1341 aa  2740    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  58.48 
 
 		 1397 aa  1607    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  57.94 
 
 		 1395 aa  1572    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  61.04 
 
 		 1271 aa  914    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  59.69 
 
 		 1407 aa  1639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  57.64 
 
 		 1405 aa  1534    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  60.31 
 
 		 1409 aa  1662    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  58.41 
 
 		 1397 aa  1610    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  58.82 
 
 		 1400 aa  1585    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  57.94 
 
 		 1395 aa  1572    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  58.04 
 
 		 1418 aa  1562    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  90.68 
 
 		 1338 aa  2449    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  56.5 
 
 		 1394 aa  1443    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  58.11 
 
 		 1418 aa  1565    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  61.04 
 
 		 1271 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  57.71 
 
 		 1395 aa  1568    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  54.25 
 
 		 1312 aa  1412    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  43.96 
 
 		 716 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.01 
 
 		 729 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  42.56 
 
 		 906 aa  553  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 		 746 aa  543  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  41.27 
 
 		 908 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  39.73 
 
 		 746 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  40.96 
 
 		 1228 aa  537  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.59 
 
 		 905 aa  538  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  41.41 
 
 		 908 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  41.31 
 
 		 906 aa  536  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.86 
 
 		 951 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  41.11 
 
 		 724 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  40.91 
 
 		 901 aa  536  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.2 
 
 		 894 aa  532  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  40.84 
 
 		 1180 aa  533  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  40.11 
 
 		 958 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  42.41 
 
 		 951 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.28 
 
 		 951 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.41 
 
 		 951 aa  529  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.77 
 
 		 907 aa  526  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.41 
 
 		 951 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.41 
 
 		 951 aa  529  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  42.41 
 
 		 951 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.28 
 
 		 951 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.13 
 
 		 952 aa  525  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  40.99 
 
 		 952 aa  523  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  38.58 
 
 		 1176 aa  522  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  38.08 
 
 		 946 aa  522  1e-146  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.45 
 
 		 904 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  37.78 
 
 		 757 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  40.35 
 
 		 955 aa  514  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  39.86 
 
 		 931 aa  511  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.42 
 
 		 734 aa  513  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  39.89 
 
 		 953 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  40.08 
 
 		 954 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.26 
 
 		 727 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.26 
 
 		 929 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.61 
 
 		 986 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  40.73 
 
 		 933 aa  505  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  38.37 
 
 		 1171 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  40.19 
 
 		 879 aa  500  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.79 
 
 		 1003 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  41.28 
 
 		 1173 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  40 
 
 		 1188 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  39.2 
 
 		 758 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.1 
 
 		 743 aa  493  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  40.85 
 
 		 752 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  38.17 
 
 		 885 aa  485  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  39.32 
 
 		 915 aa  486  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  40.58 
 
 		 752 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  39.32 
 
 		 915 aa  486  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  37.81 
 
 		 905 aa  480  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.69 
 
 		 906 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  38.79 
 
 		 743 aa  482  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  40.44 
 
 		 752 aa  483  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 		 933 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  39.48 
 
 		 894 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  36.25 
 
 		 896 aa  483  1e-134  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  36.86 
 
 		 658 aa  479  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.08 
 
 		 873 aa  479  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  37.76 
 
 		 899 aa  476  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  37.59 
 
 		 885 aa  476  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>