More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1395 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  56.23 
 
 
1357 aa  1514    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  64.49 
 
 
1232 aa  946    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  56.62 
 
 
1405 aa  1532    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  55.36 
 
 
1418 aa  1480    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  55.43 
 
 
1418 aa  1483    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  56.21 
 
 
1370 aa  1444    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  56.5 
 
 
1395 aa  1555    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  56.35 
 
 
1398 aa  1493    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  57.14 
 
 
1395 aa  1575    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  66.3 
 
 
1271 aa  969    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  54.71 
 
 
1427 aa  1485    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  59.83 
 
 
1394 aa  1564    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  57.01 
 
 
1397 aa  1570    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  55.59 
 
 
1403 aa  1536    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  57 
 
 
1407 aa  1585    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  55.5 
 
 
1418 aa  1486    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  58.53 
 
 
1383 aa  1612    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  55.43 
 
 
1418 aa  1483    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  55.32 
 
 
1401 aa  1527    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  55.59 
 
 
1400 aa  1503    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  52.32 
 
 
1313 aa  1317    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
1384 aa  2832    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  60.4 
 
 
1405 aa  1648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  57.12 
 
 
1395 aa  1574    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  66.11 
 
 
1271 aa  967    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  57.29 
 
 
1342 aa  1491    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  66.39 
 
 
1257 aa  968    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  55.43 
 
 
1418 aa  1483    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  57.17 
 
 
1397 aa  1575    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  57.12 
 
 
1395 aa  1574    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  56.29 
 
 
1317 aa  1514    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  56.52 
 
 
1338 aa  1525    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  57.28 
 
 
1409 aa  1603    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  55.57 
 
 
1418 aa  1486    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  55.44 
 
 
1341 aa  1495    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  66.11 
 
 
1271 aa  967    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  55.08 
 
 
1312 aa  1486    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  60.03 
 
 
1396 aa  1607    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  44.04 
 
 
716 aa  625  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  41.28 
 
 
746 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  43.09 
 
 
906 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  41.7 
 
 
724 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  41.14 
 
 
746 aa  562  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.9 
 
 
729 aa  559  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  43.31 
 
 
1180 aa  556  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  40.99 
 
 
908 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.03 
 
 
905 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  41.35 
 
 
946 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  39.33 
 
 
757 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  41.12 
 
 
727 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  40.2 
 
 
958 aa  550  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  42.02 
 
 
734 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  41.04 
 
 
1228 aa  544  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  41.09 
 
 
901 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  40.71 
 
 
908 aa  543  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.87 
 
 
906 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.95 
 
 
743 aa  537  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.03 
 
 
951 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.03 
 
 
951 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.9 
 
 
904 aa  534  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.3 
 
 
951 aa  534  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.9 
 
 
951 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  43.03 
 
 
951 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  42.9 
 
 
951 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  43.03 
 
 
951 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.03 
 
 
951 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  42.82 
 
 
933 aa  530  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  41.98 
 
 
931 aa  530  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.3 
 
 
929 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  40.5 
 
 
952 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  40.8 
 
 
879 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  39.23 
 
 
743 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 
955 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.45 
 
 
952 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  42.03 
 
 
954 aa  516  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.23 
 
 
894 aa  516  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  38.38 
 
 
1176 aa  515  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.96 
 
 
986 aa  516  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.37 
 
 
907 aa  512  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  39.83 
 
 
1188 aa  513  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  39.05 
 
 
899 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.49 
 
 
1003 aa  509  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  37.38 
 
 
1171 aa  508  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4945  nitrate reductase  38.56 
 
 
905 aa  505  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  40.24 
 
 
953 aa  505  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  36.9 
 
 
967 aa  506  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.53 
 
 
906 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  37.38 
 
 
907 aa  499  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  39.51 
 
 
885 aa  499  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  37.43 
 
 
758 aa  499  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  39.62 
 
 
915 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  36.74 
 
 
896 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  38.8 
 
 
885 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  39.36 
 
 
915 aa  493  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  41.49 
 
 
1173 aa  491  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  39.36 
 
 
915 aa  493  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  41.78 
 
 
933 aa  488  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  39.04 
 
 
897 aa  486  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  40.06 
 
 
885 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.82 
 
 
727 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>