More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3054 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  58.68 
 
 		 759 aa  905    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2052  nitrate reductase, catalytic subunit  45.84 
 
 		 692 aa  650    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1767  nitrate reductase, catalytic subunit  46.28 
 
 		 692 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 741 aa  1554    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  37.91 
 
 		 1176 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.8 
 
 		 734 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.05 
 
 		 727 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  37.25 
 
 		 1171 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  37.7 
 
 		 906 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  37.5 
 
 		 908 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.64 
 
 		 905 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  36.35 
 
 		 734 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.06 
 
 		 904 aa  428  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  36.2 
 
 		 1228 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.38 
 
 		 727 aa  422  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.54 
 
 		 746 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  36.68 
 
 		 746 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  37.43 
 
 		 901 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  37.18 
 
 		 1180 aa  421  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  36.06 
 
 		 744 aa  420  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  36.3 
 
 		 734 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  36.55 
 
 		 716 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  34.97 
 
 		 1188 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  35.72 
 
 		 908 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.83 
 
 		 951 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.14 
 
 		 907 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.83 
 
 		 951 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.97 
 
 		 951 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.97 
 
 		 951 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.83 
 
 		 951 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.87 
 
 		 729 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.69 
 
 		 951 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  35.83 
 
 		 951 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  35.69 
 
 		 951 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  35.99 
 
 		 724 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  34.47 
 
 		 757 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  35.59 
 
 		 906 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  34.7 
 
 		 952 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  35.96 
 
 		 1173 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35 
 
 		 929 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  36.5 
 
 		 1396 aa  394  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.65 
 
 		 952 aa  395  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 931 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.19 
 
 		 743 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  34.34 
 
 		 964 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  34.16 
 
 		 958 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.22 
 
 		 986 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  35.64 
 
 		 1405 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  33.33 
 
 		 743 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  34.2 
 
 		 953 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.34 
 
 		 894 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1397 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 1397 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.19 
 
 		 1395 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1395 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.71 
 
 		 1232 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 1395 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 1395 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  35.44 
 
 		 762 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  34.19 
 
 		 933 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 		 954 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  34.66 
 
 		 1384 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  34.54 
 
 		 915 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  34.54 
 
 		 915 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.62 
 
 		 873 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  34.91 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  34.13 
 
 		 1418 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  34.85 
 
 		 895 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  34.49 
 
 		 1407 aa  372  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  34.73 
 
 		 752 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  35.01 
 
 		 752 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  32.41 
 
 		 946 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  34.31 
 
 		 1409 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  34.32 
 
 		 885 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 955 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  33.57 
 
 		 1400 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  34.27 
 
 		 1418 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  34.13 
 
 		 1398 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  34.73 
 
 		 752 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.24 
 
 		 1003 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.52 
 
 		 766 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  34.13 
 
 		 1418 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  34.13 
 
 		 1418 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  34.21 
 
 		 1317 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2865  molybdopterin oxidoreductase  35.09 
 
 		 894 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 		 779 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  34.13 
 
 		 1418 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  34.46 
 
 		 834 aa  369  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  33.14 
 
 		 902 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  34.13 
 
 		 1418 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  33.76 
 
 		 897 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.66 
 
 		 1383 aa  365  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  33.66 
 
 		 1312 aa  364  3e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  34.11 
 
 		 913 aa  363  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  34.85 
 
 		 897 aa  364  4e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 788 aa  363  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 1338 aa  363  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  33.85 
 
 		 1427 aa  363  8e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 		 758 aa  361  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  34 
 
 		 1257 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>