More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2539 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  50.58 
 
 		 715 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  51.38 
 
 		 706 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  51 
 
 		 714 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 766 aa  1573    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  48.98 
 
 		 708 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  47.35 
 
 		 715 aa  633  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  48.15 
 
 		 835 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  48.23 
 
 		 761 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  49.56 
 
 		 691 aa  622  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  49.36 
 
 		 862 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  47.77 
 
 		 883 aa  606  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  46.57 
 
 		 704 aa  600  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  48.62 
 
 		 680 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  47.44 
 
 		 715 aa  582  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 		 698 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  45.44 
 
 		 699 aa  562  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  45.74 
 
 		 677 aa  558  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.7 
 
 		 674 aa  537  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 674 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 674 aa  536  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  44.93 
 
 		 741 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  43.23 
 
 		 732 aa  532  1e-149  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 674 aa  529  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  43.29 
 
 		 741 aa  527  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 		 677 aa  523  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.81 
 
 		 733 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.57 
 
 		 688 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.4 
 
 		 687 aa  511  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  42.22 
 
 		 738 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.56 
 
 		 688 aa  501  1e-140  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  38.47 
 
 		 687 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  38.42 
 
 		 689 aa  496  1e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  39.02 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.93 
 
 		 676 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.79 
 
 		 917 aa  489  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.93 
 
 		 676 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.07 
 
 		 676 aa  490  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.26 
 
 		 688 aa  486  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.53 
 
 		 686 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.59 
 
 		 879 aa  486  1e-136  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.35 
 
 		 904 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.8 
 
 		 689 aa  486  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.54 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  38.2 
 
 		 745 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  41.14 
 
 		 899 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.03 
 
 		 688 aa  475  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  41.1 
 
 		 709 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.79 
 
 		 901 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 900 aa  472  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  40.58 
 
 		 1173 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.61 
 
 		 893 aa  470  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.79 
 
 		 925 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.81 
 
 		 685 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  38.17 
 
 		 716 aa  459  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.73 
 
 		 1110 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  36.5 
 
 		 744 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  35.96 
 
 		 1176 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.6 
 
 		 685 aa  459  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  35.94 
 
 		 1171 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.6 
 
 		 724 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.91 
 
 		 937 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.2 
 
 		 933 aa  451  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.26 
 
 		 898 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.32 
 
 		 754 aa  452  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.28 
 
 		 668 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.37 
 
 		 1111 aa  452  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.24 
 
 		 1130 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.86 
 
 		 907 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.85 
 
 		 945 aa  448  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.8 
 
 		 894 aa  444  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  38.6 
 
 		 752 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.86 
 
 		 893 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  38.04 
 
 		 752 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  38.65 
 
 		 1232 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  37.17 
 
 		 964 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.47 
 
 		 988 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  37.76 
 
 		 752 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  37.09 
 
 		 931 aa  433  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  35.97 
 
 		 1180 aa  435  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.57 
 
 		 893 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.66 
 
 		 929 aa  435  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.89 
 
 		 952 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.69 
 
 		 906 aa  432  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  37.89 
 
 		 952 aa  432  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.18 
 
 		 988 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.32 
 
 		 988 aa  432  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.76 
 
 		 1440 aa  429  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.19 
 
 		 989 aa  428  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.88 
 
 		 900 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.95 
 
 		 989 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  36.44 
 
 		 958 aa  429  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  35.89 
 
 		 762 aa  429  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.95 
 
 		 989 aa  428  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.38 
 
 		 989 aa  426  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 		 924 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.86 
 
 		 951 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  35.1 
 
 		 734 aa  425  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.86 
 
 		 951 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>